112 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene ECH74115_0465 on replicon NC_011353
Organism: Escherichia coli O157:H7 str. EC4115



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
CP001509  ECD_00338  hypothetical protein  100 
 
 
94 aa  194  4.0000000000000005e-49  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3217  protein of unknown function DUF1255  100 
 
 
94 aa  194  4.0000000000000005e-49  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00342  hypothetical protein  100 
 
 
94 aa  194  4.0000000000000005e-49  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0418  hypothetical protein  100 
 
 
94 aa  194  4.0000000000000005e-49  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3241  hypothetical protein  100 
 
 
94 aa  194  4.0000000000000005e-49  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.436368  normal  0.0184754 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0421  hypothetical protein  100 
 
 
94 aa  194  4.0000000000000005e-49  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0308  hypothetical protein  100 
 
 
94 aa  194  4.0000000000000005e-49  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0465  hypothetical protein  100 
 
 
94 aa  194  4.0000000000000005e-49  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0862  hypothetical protein  90.43 
 
 
95 aa  177  2.9999999999999997e-44  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.325253  normal  0.891406 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0489  hypothetical protein  87.23 
 
 
94 aa  173  8e-43  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0447  hypothetical protein  87.23 
 
 
94 aa  173  8e-43  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.219742  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0428  hypothetical protein  87.23 
 
 
94 aa  173  8e-43  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0429  hypothetical protein  87.23 
 
 
94 aa  173  8e-43  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal  0.897795 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0434  hypothetical protein  86.17 
 
 
94 aa  171  2.9999999999999996e-42  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3112  hypothetical protein  72.34 
 
 
94 aa  145  2.0000000000000003e-34  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2921  hypothetical protein  73.4 
 
 
94 aa  144  5e-34  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.412619  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3312  hypothetical protein  72.34 
 
 
94 aa  143  7.0000000000000006e-34  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0998  hypothetical protein  71.28 
 
 
94 aa  142  2e-33  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.239869  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1026  hypothetical protein  72.34 
 
 
96 aa  141  3e-33  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal  0.596759 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3142  hypothetical protein  67.02 
 
 
95 aa  134  6.0000000000000005e-31  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.496899  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3292  hypothetical protein  67.02 
 
 
95 aa  134  6.0000000000000005e-31  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.739881  normal  0.161523 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3281  hypothetical protein  67.02 
 
 
95 aa  134  6.0000000000000005e-31  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2022  hypothetical protein  56.99 
 
 
93 aa  112  2.0000000000000002e-24  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.117582  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3952  hypothetical protein  54.84 
 
 
94 aa  108  4.0000000000000004e-23  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.154447  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1831  hypothetical protein  52.69 
 
 
93 aa  106  1e-22  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal  0.860734 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4248  hypothetical protein  55.91 
 
 
94 aa  103  8e-22  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.81477  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1620  hypothetical protein  55.91 
 
 
94 aa  103  8e-22  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal  0.0724993 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3668  hypothetical protein  55.91 
 
 
93 aa  102  2e-21  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_29860  hypothetical protein  53.76 
 
 
93 aa  102  2e-21  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.640265  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_44140  hypothetical protein  51.61 
 
 
93 aa  100  6e-21  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3754  hypothetical protein  51.61 
 
 
93 aa  100  8e-21  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.999044  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2513  hypothetical protein  52.69 
 
 
93 aa  100  9e-21  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.195334  normal  0.450057 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3814  hypothetical protein  52.69 
 
 
94 aa  98.2  3e-20  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.98341  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3567  hypothetical protein  52.69 
 
 
94 aa  98.2  3e-20  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2862  hypothetical protein  52.69 
 
 
93 aa  97.4  5e-20  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.0415789  n/a   
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0270  hypothetical protein  48.94 
 
 
104 aa  96.3  1e-19  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000943  hypothetical protein  49.46 
 
 
94 aa  95.9  2e-19  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.597764  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0015  hypothetical protein  50.54 
 
 
93 aa  94  6e-19  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1547  hypothetical protein  46.81 
 
 
93 aa  94  7e-19  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.440105  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1700  hypothetical protein  46.74 
 
 
112 aa  92.8  2e-18  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  hitchhiker  0.00119422  normal 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06952  hypothetical protein  49.46 
 
 
94 aa  92.8  2e-18  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02857  hypothetical protein  48.91 
 
 
94 aa  92.4  2e-18  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2532  hypothetical protein  52.69 
 
 
93 aa  91.7  3e-18  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal  0.0608768 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3196  hypothetical protein  51.09 
 
 
94 aa  91.3  4e-18  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.310619  normal  0.0162666 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1594  Fatty acid synthesis plsX protein  48.94 
 
 
94 aa  90.9  5e-18  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  hitchhiker  0.000000298358  normal 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0820  hypothetical protein  47.31 
 
 
94 aa  87  7e-17  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.740993  normal  0.0242585 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0835  hypothetical protein  46.07 
 
 
94 aa  84  6e-16  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0861  hypothetical protein  46.24 
 
 
94 aa  82.4  0.000000000000002  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  hitchhiker  0.00000128749  hitchhiker  0.0000846912 
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0656  hypothetical protein  44.68 
 
 
93 aa  81.6  0.000000000000003  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1338  hypothetical protein  40.22 
 
 
104 aa  80.9  0.000000000000005  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  1.73825e-17  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3522  protein of unknown function DUF1255  39.36 
 
 
93 aa  80.1  0.000000000000009  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.0560507  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3424  hypothetical protein  40.86 
 
 
102 aa  79.7  0.00000000000001  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal  0.310921 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2227  hypothetical protein  40.22 
 
 
104 aa  79.3  0.00000000000002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.000000123767  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3590  protein of unknown function DUF1255  39.36 
 
 
93 aa  79.3  0.00000000000002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.3016  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3497  hypothetical protein  41.49 
 
 
105 aa  78.6  0.00000000000003  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.0308826  normal  0.95157 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0761  protein of unknown function DUF1255  39.13 
 
 
104 aa  78.2  0.00000000000004  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.827861  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1041  hypothetical protein  40.22 
 
 
100 aa  77.4  0.00000000000007  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal  0.43174 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_2102  hypothetical protein  40.22 
 
 
103 aa  76.6  0.0000000000001  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1707  hypothetical protein  41.76 
 
 
103 aa  75.9  0.0000000000002  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.224011  hitchhiker  0.00197735 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0262  hypothetical protein  39.13 
 
 
103 aa  74.3  0.0000000000005  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000296906 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3759  hypothetical protein  40.22 
 
 
103 aa  74.3  0.0000000000006  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004347  SO_4467  hypothetical protein  39.13 
 
 
103 aa  73.2  0.000000000001  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2672  protein of unknown function DUF1255  40.22 
 
 
107 aa  73.2  0.000000000001  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1534  hypothetical protein  37.36 
 
 
104 aa  72.4  0.000000000002  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0263  hypothetical protein  39.13 
 
 
103 aa  72  0.000000000002  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000000961266 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0323  hypothetical protein  38.04 
 
 
103 aa  71.2  0.000000000004  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.0338978  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0913  hypothetical protein  36.96 
 
 
104 aa  71.2  0.000000000004  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1328  hypothetical protein  36.96 
 
 
104 aa  70.5  0.000000000007  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2498  hypothetical protein  36.96 
 
 
100 aa  70.5  0.000000000007  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1187  protein of unknown function DUF1255  36.96 
 
 
103 aa  70.1  0.000000000009  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.0389162 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1207  hypothetical protein  35.16 
 
 
103 aa  69.7  0.00000000001  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6412  hypothetical protein  36.96 
 
 
106 aa  69.7  0.00000000001  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.725112 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6718  protein of unknown function DUF1255  36.96 
 
 
106 aa  69.7  0.00000000001  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.042876  normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3074  protein of unknown function DUF1255  36.96 
 
 
103 aa  69.7  0.00000000001  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0269  protein of unknown function DUF1255  38.04 
 
 
103 aa  69.3  0.00000000001  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1848  hypothetical protein  39.13 
 
 
104 aa  69.3  0.00000000002  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal  0.711654 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2688  hypothetical protein  34.07 
 
 
105 aa  68.9  0.00000000002  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2901  hypothetical protein  35.16 
 
 
103 aa  68.9  0.00000000002  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.649398  normal  0.620309 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0273  hypothetical protein  38.04 
 
 
103 aa  69.3  0.00000000002  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0273  hypothetical protein  36.96 
 
 
103 aa  68.2  0.00000000003  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0265  hypothetical protein  36.96 
 
 
103 aa  68.2  0.00000000003  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2762  hypothetical protein  37.36 
 
 
105 aa  68.2  0.00000000004  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1300  hypothetical protein  38.04 
 
 
106 aa  68.2  0.00000000004  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.441268  normal 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C1372  hypothetical protein  36.96 
 
 
106 aa  67.8  0.00000000004  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3823  hypothetical protein  38.04 
 
 
106 aa  68.2  0.00000000004  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4545  hypothetical protein  38.04 
 
 
106 aa  68.2  0.00000000004  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.593261  normal  0.283548 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0379  hypothetical protein  36.96 
 
 
103 aa  68.2  0.00000000004  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5759  hypothetical protein  38.04 
 
 
106 aa  68.2  0.00000000004  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.233013  normal 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3969  hypothetical protein  38.04 
 
 
106 aa  67.8  0.00000000005  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.539979  normal  0.0411996 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1508  protein of unknown function DUF1255  38.46 
 
 
103 aa  67  0.00000000008  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  hitchhiker  0.00328821  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3029  hypothetical protein  35.16 
 
 
103 aa  66.6  0.00000000009  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.249045  normal  0.859497 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4838  hypothetical protein  36.36 
 
 
104 aa  66.6  0.0000000001  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1778  hypothetical protein  34.78 
 
 
104 aa  66.6  0.0000000001  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.0253213  normal  0.0734741 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4775  hypothetical protein  35.16 
 
 
105 aa  66.6  0.0000000001  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal  0.0876813 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1951  protein of unknown function DUF1255  35.87 
 
 
104 aa  65.1  0.0000000003  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.531149  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3765  protein of unknown function DUF1255  38.04 
 
 
108 aa  65.5  0.0000000003  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4431  hypothetical protein  36.96 
 
 
106 aa  64.7  0.0000000004  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2742  hypothetical protein  36.26 
 
 
105 aa  64.3  0.0000000005  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.156503  normal 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4104  hypothetical protein  36.96 
 
 
106 aa  64.3  0.0000000005  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2232  protein of unknown function DUF1255  36.26 
 
 
105 aa  64.3  0.0000000005  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.470813  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>