112 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PSPTO_2022 on replicon NC_004578
Organism: Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_004578  PSPTO_2022  hypothetical protein  100 
 
 		 93 aa  195  2.0000000000000003e-49  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.117582  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1831  hypothetical protein  91.4 
 
 		 93 aa  184  3e-46  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.860734 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3952  hypothetical protein  88.17 
 
 		 94 aa  177  5.999999999999999e-44  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.154447  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_29860  hypothetical protein  79.57 
 
 		 93 aa  158  2e-38  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.640265  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3567  hypothetical protein  78.49 
 
 		 94 aa  157  6e-38  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4248  hypothetical protein  77.42 
 
 		 94 aa  156  1e-37  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.81477  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2513  hypothetical protein  77.42 
 
 		 93 aa  156  1e-37  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.195334  normal  0.450057 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1620  hypothetical protein  77.42 
 
 		 94 aa  156  1e-37  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.0724993 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3754  hypothetical protein  76.34 
 
 		 93 aa  154  3e-37  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.999044  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_44140  hypothetical protein  76.34 
 
 		 93 aa  154  5.0000000000000005e-37  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3814  hypothetical protein  76.34 
 
 		 94 aa  153  8e-37  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.98341  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0015  hypothetical protein  65.22 
 
 		 93 aa  124  6e-28  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3668  hypothetical protein  59.78 
 
 		 93 aa  118  1.9999999999999998e-26  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1594  Fatty acid synthesis plsX protein  61.96 
 
 		 94 aa  117  3.9999999999999996e-26  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  hitchhiker  0.000000298358  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1700  hypothetical protein  61.54 
 
 		 112 aa  117  3.9999999999999996e-26  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  hitchhiker  0.00119422  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1547  hypothetical protein  58.7 
 
 		 93 aa  117  4.9999999999999996e-26  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.440105  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0820  hypothetical protein  59.78 
 
 		 94 aa  115  1.9999999999999998e-25  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.740993  normal  0.0242585 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02857  hypothetical protein  58.24 
 
 		 94 aa  115  1.9999999999999998e-25  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2862  hypothetical protein  56.52 
 
 		 93 aa  113  8.999999999999998e-25  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.0415789  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0835  hypothetical protein  57.61 
 
 		 94 aa  113  1.0000000000000001e-24  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_00338  hypothetical protein  56.99 
 
 		 94 aa  112  2.0000000000000002e-24  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3217  protein of unknown function DUF1255  56.99 
 
 		 94 aa  112  2.0000000000000002e-24  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00342  hypothetical protein  56.99 
 
 		 94 aa  112  2.0000000000000002e-24  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0418  hypothetical protein  56.99 
 
 		 94 aa  112  2.0000000000000002e-24  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3241  hypothetical protein  56.99 
 
 		 94 aa  112  2.0000000000000002e-24  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.436368  normal  0.0184754 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0421  hypothetical protein  56.99 
 
 		 94 aa  112  2.0000000000000002e-24  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0308  hypothetical protein  56.99 
 
 		 94 aa  112  2.0000000000000002e-24  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0465  hypothetical protein  56.99 
 
 		 94 aa  112  2.0000000000000002e-24  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2921  hypothetical protein  58.06 
 
 		 94 aa  112  2.0000000000000002e-24  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.412619  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3112  hypothetical protein  55.91 
 
 		 94 aa  109  1.0000000000000001e-23  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2532  hypothetical protein  57.61 
 
 		 93 aa  109  1.0000000000000001e-23  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0608768 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0862  hypothetical protein  55.91 
 
 		 95 aa  109  1.0000000000000001e-23  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.325253  normal  0.891406 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3196  hypothetical protein  56.52 
 
 		 94 aa  106  1e-22  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.310619  normal  0.0162666 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0489  hypothetical protein  52.69 
 
 		 94 aa  105  2e-22  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0447  hypothetical protein  52.69 
 
 		 94 aa  105  2e-22  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.219742  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0428  hypothetical protein  52.69 
 
 		 94 aa  105  2e-22  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0429  hypothetical protein  52.69 
 
 		 94 aa  105  2e-22  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  0.897795 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0434  hypothetical protein  51.61 
 
 		 94 aa  104  4e-22  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0270  hypothetical protein  53.26 
 
 		 104 aa  103  6e-22  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0861  hypothetical protein  54.35 
 
 		 94 aa  103  1e-21  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  hitchhiker  0.00000128749  hitchhiker  0.0000846912 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0998  hypothetical protein  53.76 
 
 		 94 aa  101  4e-21  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.239869  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3312  hypothetical protein  53.76 
 
 		 94 aa  101  4e-21  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1026  hypothetical protein  55.91 
 
 		 96 aa  100  7e-21  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.596759 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3142  hypothetical protein  51.61 
 
 		 95 aa  97.8  4e-20  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.496899  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3292  hypothetical protein  51.61 
 
 		 95 aa  97.8  4e-20  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.739881  normal  0.161523 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3281  hypothetical protein  51.61 
 
 		 95 aa  97.8  4e-20  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0656  hypothetical protein  47.83 
 
 		 93 aa  93.6  9e-19  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0761  protein of unknown function DUF1255  48.31 
 
 		 104 aa  92.4  2e-18  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.827861  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0262  hypothetical protein  50 
 
 		 103 aa  89  2e-17  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000296906 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3759  hypothetical protein  51.09 
 
 		 103 aa  89  2e-17  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_2102  hypothetical protein  48.35 
 
 		 103 aa  88.2  3e-17  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000943  hypothetical protein  48.89 
 
 		 94 aa  88.2  3e-17  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.597764  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_4467  hypothetical protein  47.83 
 
 		 103 aa  87  9e-17  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1534  hypothetical protein  46.07 
 
 		 104 aa  86.7  1e-16  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0263  hypothetical protein  47.83 
 
 		 103 aa  85.5  2e-16  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000961266 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0273  hypothetical protein  47.25 
 
 		 103 aa  85.9  2e-16  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0265  hypothetical protein  47.25 
 
 		 103 aa  85.9  2e-16  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3497  hypothetical protein  44.57 
 
 		 105 aa  85.5  2e-16  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.0308826  normal  0.95157 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0273  hypothetical protein  47.25 
 
 		 103 aa  85.9  2e-16  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06952  hypothetical protein  48.89 
 
 		 94 aa  85.1  3e-16  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0269  protein of unknown function DUF1255  46.15 
 
 		 103 aa  84.3  5e-16  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0379  hypothetical protein  46.15 
 
 		 103 aa  84  6e-16  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1328  hypothetical protein  45.05 
 
 		 104 aa  80.9  0.000000000000005  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3424  hypothetical protein  45.05 
 
 		 102 aa  80.9  0.000000000000005  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  0.310921 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2227  hypothetical protein  42.39 
 
 		 104 aa  81.3  0.000000000000005  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.000000123767  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1338  hypothetical protein  42.86 
 
 		 104 aa  80.5  0.000000000000007  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  1.73825e-17  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0323  hypothetical protein  43.96 
 
 		 103 aa  79.3  0.00000000000002  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.0338978  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0281  hypothetical protein  41.76 
 
 		 103 aa  78.2  0.00000000000004  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3522  protein of unknown function DUF1255  39.13 
 
 		 93 aa  77  0.00000000000008  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.0560507  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1778  hypothetical protein  41.76 
 
 		 104 aa  76.6  0.00000000000009  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.0253213  normal  0.0734741 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4838  hypothetical protein  40.23 
 
 		 104 aa  76.3  0.0000000000001  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0400  hypothetical protein  38.2 
 
 		 93 aa  76.6  0.0000000000001  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3590  protein of unknown function DUF1255  38.04 
 
 		 93 aa  75.5  0.0000000000002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.3016  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1951  protein of unknown function DUF1255  39.56 
 
 		 104 aa  74.3  0.0000000000005  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.531149  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3372  hypothetical protein  39.56 
 
 		 104 aa  73.6  0.0000000000009  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2498  hypothetical protein  39.33 
 
 		 100 aa  73.2  0.000000000001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4775  hypothetical protein  41.76 
 
 		 105 aa  73.2  0.000000000001  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0876813 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2828  protein of unknown function DUF1255  39.56 
 
 		 105 aa  73.6  0.000000000001  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.948708  normal  0.862924 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2422  protein of unknown function DUF1255  39.56 
 
 		 105 aa  73.6  0.000000000001  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1508  protein of unknown function DUF1255  41.76 
 
 		 103 aa  72.4  0.000000000002  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  hitchhiker  0.00328821  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1187  protein of unknown function DUF1255  40.45 
 
 		 103 aa  72.4  0.000000000002  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.0389162 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1041  hypothetical protein  39.77 
 
 		 100 aa  72.8  0.000000000002  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.43174 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2552  hypothetical protein  38.46 
 
 		 119 aa  72  0.000000000003  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.271143  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3074  protein of unknown function DUF1255  39.33 
 
 		 103 aa  70.5  0.000000000008  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C1372  hypothetical protein  37.36 
 
 		 106 aa  70.1  0.000000000009  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6412  hypothetical protein  37.36 
 
 		 106 aa  68.6  0.00000000003  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.725112 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2901  hypothetical protein  37.36 
 
 		 103 aa  68.2  0.00000000004  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.649398  normal  0.620309 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6718  protein of unknown function DUF1255  36.26 
 
 		 106 aa  67.8  0.00000000005  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.042876  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3029  hypothetical protein  36.26 
 
 		 103 aa  66.2  0.0000000001  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.249045  normal  0.859497 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1707  hypothetical protein  36.26 
 
 		 103 aa  66.6  0.0000000001  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.224011  hitchhiker  0.00197735 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3969  hypothetical protein  37.36 
 
 		 106 aa  66.6  0.0000000001  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.539979  normal  0.0411996 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1403  hypothetical protein  38.46 
 
 		 108 aa  66.2  0.0000000001  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.148059  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1300  hypothetical protein  36.26 
 
 		 106 aa  65.1  0.0000000003  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.441268  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3823  hypothetical protein  36.26 
 
 		 106 aa  65.1  0.0000000003  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4545  hypothetical protein  36.26 
 
 		 106 aa  65.1  0.0000000003  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.593261  normal  0.283548 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5759  hypothetical protein  36.26 
 
 		 106 aa  65.1  0.0000000003  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.233013  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4431  hypothetical protein  36.26 
 
 		 106 aa  65.1  0.0000000003  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2762  hypothetical protein  36.26 
 
 		 105 aa  63.5  0.0000000008  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0913  hypothetical protein  31.52 
 
 		 104 aa  63.2  0.000000001  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1848  hypothetical protein  32.61 
 
 		 104 aa  62  0.000000003  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  0.711654 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>