16 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rmet_0476 on replicon NC_007973
Organism: Cupriavidus metallidurans CH34



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007973  Rmet_0476  hypothetical protein  100 
 
 		 154 aa  295  2e-79  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0536  hypothetical protein  53.16 
 
 		 235 aa  74.3  0.0000000000005  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.497522  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2916  hypothetical protein  52.94 
 
 		 149 aa  71.6  0.000000000004  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0869  proline-rich region  45.35 
 
 		 161 aa  61.2  0.000000004  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.426723  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0152  proline-rich region  48.65 
 
 		 154 aa  58.9  0.00000002  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2597  hypothetical protein  41.61 
 
 		 217 aa  52.8  0.000002  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0285  hypothetical protein  50 
 
 		 111 aa  51.6  0.000004  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  decreased coverage  0.00144128  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3442  hypothetical protein  45.45 
 
 		 190 aa  50.8  0.000006  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    decreased coverage  3.6631e-29 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0819  hypothetical protein  41.38 
 
 		 183 aa  49.3  0.00002  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  decreased coverage  0.0000000980503  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2680  hypothetical protein  34.06 
 
 		 152 aa  48.1  0.00005  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.298826  normal  0.0266108 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5384  hypothetical protein  48.94 
 
 		 133 aa  44.7  0.0005  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.402994  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5477  hypothetical protein  48.94 
 
 		 133 aa  44.7  0.0005  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0700424  normal  0.611211 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4792  hypothetical protein  48.94 
 
 		 108 aa  44.3  0.0006  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.920586  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3535  hypothetical protein  30.43 
 
 		 108 aa  44.3  0.0006  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.0147192  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0176  hypothetical protein  46.81 
 
 		 108 aa  43.9  0.0007  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.364486 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2108  hypothetical protein  58.06 
 
 		 189 aa  43.9  0.0008  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>