14 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Daro_2680 on replicon NC_007298
Organism: Dechloromonas aromatica RCB



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007298  Daro_2680  hypothetical protein  100 
 
 		 152 aa  308  2e-83  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.298826  normal  0.0266108 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2973  hypothetical protein  45.24 
 
 		 127 aa  72.4  0.000000000002  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.96196  normal  0.969875 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0176  hypothetical protein  54.35 
 
 		 108 aa  50.4  0.000009  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.364486 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2597  hypothetical protein  32.3 
 
 		 217 aa  50.4  0.000009  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5384  hypothetical protein  50 
 
 		 133 aa  49.7  0.00002  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.402994  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5477  hypothetical protein  50 
 
 		 133 aa  49.7  0.00002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0700424  normal  0.611211 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3308  hypothetical protein  50 
 
 		 108 aa  49.3  0.00002  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.76  normal  0.141564 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4792  hypothetical protein  50 
 
 		 108 aa  48.9  0.00003  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.920586  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0285  hypothetical protein  50 
 
 		 111 aa  47  0.00009  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  decreased coverage  0.00144128  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0536  hypothetical protein  47.37 
 
 		 235 aa  46.2  0.0002  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.497522  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2916  hypothetical protein  50 
 
 		 149 aa  45.8  0.0002  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0869  proline-rich region  44.23 
 
 		 161 aa  43.5  0.001  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.426723  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0476  hypothetical protein  45.83 
 
 		 154 aa  42  0.003  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1537  hypothetical protein  31.97 
 
 		 101 aa  42  0.003  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.0237027  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>