21 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Daro_0285 on replicon NC_007298
Organism: Dechloromonas aromatica RCB



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007298  Daro_0285  hypothetical protein  100 
 
 		 111 aa  215  1e-55  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  decreased coverage  0.00144128  normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0869  proline-rich region  54.17 
 
 		 161 aa  65.1  0.0000000003  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.426723  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0152  proline-rich region  54.67 
 
 		 154 aa  63.5  0.0000000009  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2597  hypothetical protein  62.32 
 
 		 217 aa  58.9  0.00000002  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0476  hypothetical protein  49.02 
 
 		 154 aa  53.5  0.0000009  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3535  hypothetical protein  45.71 
 
 		 108 aa  52.8  0.000001  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.0147192  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0819  hypothetical protein  49.12 
 
 		 183 aa  51.6  0.000003  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  decreased coverage  0.0000000980503  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5384  hypothetical protein  47.73 
 
 		 133 aa  52  0.000003  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.402994  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5477  hypothetical protein  47.73 
 
 		 133 aa  52  0.000003  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0700424  normal  0.611211 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0536  hypothetical protein  44.62 
 
 		 235 aa  50.8  0.000006  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.497522  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4792  hypothetical protein  47.73 
 
 		 108 aa  50.8  0.000006  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.920586  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3442  hypothetical protein  58.33 
 
 		 190 aa  50.4  0.000007  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    decreased coverage  3.6631e-29 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0176  hypothetical protein  45.45 
 
 		 108 aa  50.4  0.000007  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.364486 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0233  hypothetical protein  49.02 
 
 		 126 aa  50.4  0.000008  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  unclonable  3.86465e-19  hitchhiker  8.74497e-18 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2108  hypothetical protein  60.98 
 
 		 189 aa  50.1  0.000009  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2680  hypothetical protein  52.17 
 
 		 152 aa  49.3  0.00002  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.298826  normal  0.0266108 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3308  hypothetical protein  47.73 
 
 		 108 aa  49.3  0.00002  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.76  normal  0.141564 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0147  hypothetical protein  47.83 
 
 		 226 aa  47.8  0.00005  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2916  hypothetical protein  40.51 
 
 		 149 aa  47  0.00009  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2973  hypothetical protein  48.84 
 
 		 127 aa  45.1  0.0003  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.96196  normal  0.969875 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1296  hypothetical protein  38.38 
 
 		 176 aa  40.4  0.009  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.143456  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>