19 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Nmul_A0152 on replicon NC_007614
Organism: Nitrosospira multiformis ATCC 25196



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007614  Nmul_A0152  proline-rich region  100 
 
 
154 aa  300  5.000000000000001e-81  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0869  proline-rich region  72 
 
 
161 aa  101  4e-21  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.426723  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2597  hypothetical protein  59.18 
 
 
217 aa  62.4  0.000000002  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0819  hypothetical protein  48.21 
 
 
183 aa  60.8  0.000000007  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  decreased coverage  0.0000000980503  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3442  hypothetical protein  46.3 
 
 
190 aa  57  0.00000009  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    decreased coverage  3.6631e-29 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0536  hypothetical protein  44.62 
 
 
235 aa  56.6  0.0000001  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.497522  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2108  hypothetical protein  60 
 
 
189 aa  56.6  0.0000001  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0476  hypothetical protein  52.94 
 
 
154 aa  55.5  0.0000003  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0285  hypothetical protein  56.82 
 
 
111 aa  55.1  0.0000003  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  decreased coverage  0.00144128  normal 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0147  hypothetical protein  54 
 
 
226 aa  54.7  0.0000004  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2916  hypothetical protein  48 
 
 
149 aa  46.6  0.0001  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2680  hypothetical protein  28.21 
 
 
152 aa  46.6  0.0001  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.298826  normal  0.0266108 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2973  hypothetical protein  50 
 
 
127 aa  45.1  0.0003  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.96196  normal  0.969875 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0233  hypothetical protein  55.56 
 
 
126 aa  43.5  0.001  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  unclonable  3.86465e-19  hitchhiker  8.74497e-18 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6178  hypothetical protein  30.19 
 
 
146 aa  43.5  0.001  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5384  hypothetical protein  42.86 
 
 
133 aa  41.6  0.004  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.402994  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5477  hypothetical protein  42.86 
 
 
133 aa  41.6  0.004  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0700424  normal  0.611211 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0176  hypothetical protein  39.13 
 
 
108 aa  40.8  0.007  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.364486 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4792  hypothetical protein  41.3 
 
 
108 aa  40.4  0.009  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.920586  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>