17 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bcen2424_5477 on replicon NC_008543
Organism: Burkholderia cenocepacia HI2424



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008061  Bcen_5384  hypothetical protein  100 
 
 
133 aa  260  4.999999999999999e-69  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.402994  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5477  hypothetical protein  100 
 
 
133 aa  260  4.999999999999999e-69  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0700424  normal  0.611211 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4792  hypothetical protein  99.07 
 
 
108 aa  209  1e-53  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.920586  normal 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0176  hypothetical protein  91.67 
 
 
108 aa  117  6e-26  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.364486 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3308  hypothetical protein  84.62 
 
 
108 aa  106  1e-22  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.76  normal  0.141564 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2916  hypothetical protein  51.06 
 
 
149 aa  52.4  0.000002  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0285  hypothetical protein  44.79 
 
 
111 aa  52.4  0.000002  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  decreased coverage  0.00144128  normal 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2680  hypothetical protein  48.98 
 
 
152 aa  48.9  0.00002  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.298826  normal  0.0266108 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0536  hypothetical protein  39.39 
 
 
235 aa  49.3  0.00002  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.497522  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0152  proline-rich region  43.75 
 
 
154 aa  48.9  0.00002  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0476  hypothetical protein  53.19 
 
 
154 aa  48.5  0.00003  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0869  proline-rich region  42.86 
 
 
161 aa  44.7  0.0004  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.426723  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0819  hypothetical protein  39.74 
 
 
183 aa  44.7  0.0004  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  decreased coverage  0.0000000980503  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3442  hypothetical protein  46.81 
 
 
190 aa  44.7  0.0005  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    decreased coverage  3.6631e-29 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2973  hypothetical protein  53.33 
 
 
127 aa  43.1  0.001  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.96196  normal  0.969875 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2597  hypothetical protein  35.67 
 
 
217 aa  42.7  0.002  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0233  hypothetical protein  36.71 
 
 
126 aa  40  0.01  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  unclonable  3.86465e-19  hitchhiker  8.74497e-18 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>