34 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rmar_2523 on replicon NC_013501
Organism: Rhodothermus marinus DSM 4252



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013501  Rmar_2523  metal-dependent hydrolase  100 
 
 
186 aa  373  1e-102  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  hitchhiker  0.00251032  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2476  metal-dependent hydrolase  52.07 
 
 
173 aa  192  2e-48  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.000196121  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2729  metal-dependent hydrolase  52.07 
 
 
173 aa  192  2e-48  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  decreased coverage  0.0000144697  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2515  metal-dependent hydrolase  51.48 
 
 
173 aa  191  4e-48  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.0719464  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2714  metal-dependent hydrolase  51.48 
 
 
173 aa  191  4e-48  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000000000896185 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2719  metal-dependent hydrolase  51.48 
 
 
173 aa  191  4e-48  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.929825  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2766  metal-dependent hydrolase  51.48 
 
 
173 aa  191  4e-48  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.603683  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2700  metal-dependent hydrolase  51.48 
 
 
173 aa  191  4e-48  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2589  metal-dependent hydrolase  51.48 
 
 
173 aa  191  8e-48  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal  0.0454538 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2441  metal-dependent hydrolase  50.89 
 
 
173 aa  190  1e-47  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1075  metal-dependent hydrolase  51.16 
 
 
184 aa  186  2e-46  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal  0.0128131 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2443  metal-dependent hydrolase  50.9 
 
 
173 aa  185  3e-46  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.012145  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0486  metal-dependent hydrolase  43.53 
 
 
181 aa  171  6.999999999999999e-42  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1163  metal-dependent hydrolase  45.83 
 
 
179 aa  170  1e-41  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal  0.239343 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4996  metal-dependent hydrolase  47.88 
 
 
176 aa  158  4e-38  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  hitchhiker  0.00599507  normal  0.925082 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1407  metal-dependent hydrolase  47.95 
 
 
178 aa  157  8e-38  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1829  metal-dependent hydrolase  49.12 
 
 
170 aa  155  2e-37  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  normal  0.506926 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3068  metal-dependent hydrolase  45.24 
 
 
180 aa  154  6e-37  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0602  metal-dependent hydrolase  43.6 
 
 
176 aa  151  5e-36  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  unclonable  0.00000000000384041  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2272  hypothetical protein  42.33 
 
 
186 aa  143  1e-33  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.157492  normal  0.0894472 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3488  hypothetical protein  44.22 
 
 
158 aa  131  3.9999999999999996e-30  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.7638  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4437  hypothetical protein  36.94 
 
 
157 aa  111  7.000000000000001e-24  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2528  hypothetical protein  33.33 
 
 
161 aa  71.6  0.000000000006  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.566814  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2164  hypothetical protein  30.28 
 
 
167 aa  63.9  0.000000001  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.68682  normal 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0125  metal-dependent hydrolase  28.86 
 
 
161 aa  58.2  0.00000008  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4719  hypothetical protein  31.36 
 
 
163 aa  55.1  0.0000007  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.164513  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4718  hypothetical protein  27.05 
 
 
165 aa  53.1  0.000003  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.841461  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0463  hypothetical protein  31.62 
 
 
152 aa  51.6  0.000006  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal  0.940424 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1039  hypothetical protein  28 
 
 
162 aa  47.4  0.0001  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2154  hypothetical protein  27.61 
 
 
151 aa  46.2  0.0003  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.203203  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3701  hypothetical protein  25.4 
 
 
168 aa  43.5  0.002  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal  0.402351 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2954  hypothetical protein  29.6 
 
 
157 aa  42  0.006  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.231645  normal 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0810  hypothetical protein  27.43 
 
 
166 aa  41.6  0.007  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2967  hypothetical protein  32.63 
 
 
169 aa  40.8  0.01  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>