24 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dfer_4996 on replicon NC_013037
Organism: Dyadobacter fermentans DSM 18053



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013037  Dfer_4996  metal-dependent hydrolase  100 
 
 
176 aa  363  1e-100  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  hitchhiker  0.00599507  normal  0.925082 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2272  hypothetical protein  57.23 
 
 
186 aa  220  6e-57  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.157492  normal  0.0894472 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0486  metal-dependent hydrolase  46.02 
 
 
181 aa  185  2e-46  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2476  metal-dependent hydrolase  50.86 
 
 
173 aa  177  8e-44  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.000196121  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2515  metal-dependent hydrolase  50.86 
 
 
173 aa  176  1e-43  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.0719464  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2714  metal-dependent hydrolase  50.86 
 
 
173 aa  176  1e-43  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000000000896185 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2766  metal-dependent hydrolase  50.86 
 
 
173 aa  176  1e-43  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.603683  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2729  metal-dependent hydrolase  50.86 
 
 
173 aa  176  1e-43  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  decreased coverage  0.0000144697  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2700  metal-dependent hydrolase  50.86 
 
 
173 aa  176  1e-43  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2719  metal-dependent hydrolase  50.86 
 
 
173 aa  176  2e-43  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.929825  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2441  metal-dependent hydrolase  50.86 
 
 
173 aa  176  2e-43  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2589  metal-dependent hydrolase  50.86 
 
 
173 aa  175  3e-43  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal  0.0454538 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2443  metal-dependent hydrolase  49.71 
 
 
173 aa  172  2.9999999999999996e-42  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.012145  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3068  metal-dependent hydrolase  45.71 
 
 
180 aa  166  1e-40  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1075  metal-dependent hydrolase  46.89 
 
 
184 aa  166  1e-40  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal  0.0128131 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1163  metal-dependent hydrolase  46.51 
 
 
179 aa  164  5e-40  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal  0.239343 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0602  metal-dependent hydrolase  42.29 
 
 
176 aa  160  1e-38  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  unclonable  0.00000000000384041  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1829  metal-dependent hydrolase  46.15 
 
 
170 aa  159  2e-38  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  normal  0.506926 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2523  metal-dependent hydrolase  47.88 
 
 
186 aa  158  3e-38  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  hitchhiker  0.00251032  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1407  metal-dependent hydrolase  40 
 
 
178 aa  149  2e-35  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3488  hypothetical protein  42.34 
 
 
158 aa  111  5e-24  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.7638  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4437  hypothetical protein  34.53 
 
 
157 aa  87.8  7e-17  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2528  hypothetical protein  29.33 
 
 
161 aa  69.3  0.00000000003  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.566814  normal 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0125  metal-dependent hydrolase  26.09 
 
 
161 aa  41.6  0.005  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>