30 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rmar_2432 on replicon NC_013501
Organism: Rhodothermus marinus DSM 4252



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013501  Rmar_2432  hypothetical protein  100 
 
 
101 aa  204  2e-52  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2869  hypothetical protein  57.3 
 
 
104 aa  105  3e-22  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1139  hypothetical protein  55.29 
 
 
102 aa  101  4e-21  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009472  Acry_3623  hypothetical protein  59.42 
 
 
96 aa  92  2e-18  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0127  hypothetical protein  54.05 
 
 
90 aa  90.5  7e-18  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.00495666  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1231  hypothetical protein  54.79 
 
 
90 aa  89.7  1e-17  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2980  hypothetical protein  49.33 
 
 
89 aa  87.4  7e-17  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1935  hypothetical protein  47.5 
 
 
90 aa  86.7  1e-16  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.795864  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4103  hypothetical protein  55.22 
 
 
78 aa  84.3  5e-16  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.918286  normal 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1907  hypothetical protein  46.67 
 
 
90 aa  78.6  0.00000000000003  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal  0.0497994 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1434  hypothetical protein  47.22 
 
 
85 aa  74.7  0.0000000000004  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2916  hypothetical protein  55.88 
 
 
82 aa  71.2  0.000000000005  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.480647  normal  0.0883091 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2919  hypothetical protein  46.34 
 
 
179 aa  69.3  0.00000000001  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2917  hypothetical protein  52.94 
 
 
84 aa  69.3  0.00000000002  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.862357  n/a   
 
 
-
 
NC_009467  Acry_3249  hypothetical protein  55.36 
 
 
71 aa  67.8  0.00000000005  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.0322757  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3327  hypothetical protein  54.41 
 
 
82 aa  67.4  0.00000000007  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.86974  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2375  hypothetical protein  53.73 
 
 
73 aa  66.6  0.0000000001  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.0792048  normal 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1574  hypothetical protein  50 
 
 
82 aa  65.5  0.0000000002  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1777  hypothetical protein  47.69 
 
 
84 aa  64.7  0.0000000004  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.256897  normal  0.805615 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4037  hypothetical protein  48.53 
 
 
82 aa  63.5  0.0000000009  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal  0.0386053 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4275  hypothetical protein  37.14 
 
 
79 aa  58.9  0.00000002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.532653  normal  0.601848 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0811  hypothetical protein  43.42 
 
 
77 aa  58.2  0.00000004  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4993  hypothetical protein  40.3 
 
 
92 aa  55.5  0.0000002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.819538  normal  0.0403555 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2603  hypothetical protein  34.67 
 
 
80 aa  56.2  0.0000002  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.355164  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3433  hypothetical protein  35.44 
 
 
77 aa  53.5  0.000001  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.14303  normal 
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0949  hypothetical protein  34.33 
 
 
80 aa  50.4  0.000008  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  hitchhiker  0.0000000036055  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1958  hypothetical protein  30 
 
 
80 aa  49.3  0.00002  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  decreased coverage  0.0000000000377235  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2643  hypothetical protein  28.36 
 
 
79 aa  42.4  0.002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2416  hypothetical protein  30.12 
 
 
123 aa  42  0.003  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.82077  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1209  hypothetical protein  31.43 
 
 
86 aa  40.8  0.006  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>