18 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Suden_1958 on replicon NC_007575
Organism: Sulfurimonas denitrificans DSM 1251



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007575  Suden_1958  hypothetical protein  100 
 
 
80 aa  159  8.000000000000001e-39  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  decreased coverage  0.0000000000377235  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1907  hypothetical protein  41.38 
 
 
90 aa  55.8  0.0000002  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal  0.0497994 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1139  hypothetical protein  31.88 
 
 
102 aa  54.7  0.0000004  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0127  hypothetical protein  32.76 
 
 
90 aa  52.8  0.000002  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.00495666  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1231  hypothetical protein  36.21 
 
 
90 aa  52  0.000003  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2980  hypothetical protein  30.3 
 
 
89 aa  51.2  0.000005  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1935  hypothetical protein  35.53 
 
 
90 aa  49.7  0.00001  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.795864  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2432  hypothetical protein  30 
 
 
101 aa  49.3  0.00002  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2917  hypothetical protein  34.25 
 
 
84 aa  47.4  0.00006  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.862357  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2869  hypothetical protein  26.09 
 
 
104 aa  47.4  0.00007  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4103  hypothetical protein  24.14 
 
 
78 aa  45.4  0.0002  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.918286  normal 
 
 
-
 
NC_009467  Acry_3249  hypothetical protein  32.26 
 
 
71 aa  45.1  0.0003  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.0322757  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2643  hypothetical protein  33.33 
 
 
79 aa  44.3  0.0005  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0811  hypothetical protein  29.58 
 
 
77 aa  42.7  0.002  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009472  Acry_3623  hypothetical protein  24.56 
 
 
96 aa  42.4  0.002  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1434  hypothetical protein  30.43 
 
 
85 aa  41.6  0.004  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2416  hypothetical protein  27.59 
 
 
123 aa  40.8  0.007  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.82077  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4037  hypothetical protein  28.05 
 
 
82 aa  40.4  0.008  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal  0.0386053 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>