30 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ppha_1935 on replicon NC_011060
Organism: Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011060  Ppha_1935  hypothetical protein  100 
 
 		 90 aa  182  2.0000000000000003e-45  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.795864  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1907  hypothetical protein  76.67 
 
 		 90 aa  144  4.0000000000000006e-34  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  0.0497994 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1231  hypothetical protein  66.67 
 
 		 90 aa  132  1.9999999999999998e-30  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2980  hypothetical protein  46.91 
 
 		 89 aa  92.8  1e-18  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2432  hypothetical protein  47.5 
 
 		 101 aa  86.7  1e-16  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0127  hypothetical protein  47.37 
 
 		 90 aa  84  6e-16  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.00495666  n/a   
 
 
-
 
NC_009472  Acry_3623  hypothetical protein  52.7 
 
 		 96 aa  82.8  0.000000000000002  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2869  hypothetical protein  52.86 
 
 		 104 aa  82  0.000000000000003  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4103  hypothetical protein  54.55 
 
 		 78 aa  79.7  0.00000000000001  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.918286  normal  1 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1139  hypothetical protein  45.68 
 
 		 102 aa  76.6  0.00000000000009  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1434  hypothetical protein  43.75 
 
 		 85 aa  72  0.000000000002  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4993  hypothetical protein  40.54 
 
 		 92 aa  62.8  0.000000001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.819538  normal  0.0403555 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2917  hypothetical protein  43.75 
 
 		 84 aa  59.7  0.00000001  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.862357  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1574  hypothetical protein  43.28 
 
 		 82 aa  57  0.00000008  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4037  hypothetical protein  50 
 
 		 82 aa  53.9  0.0000006  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.0386053 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2919  hypothetical protein  43.75 
 
 		 179 aa  54.3  0.0000006  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009467  Acry_3249  hypothetical protein  45.31 
 
 		 71 aa  52.8  0.000001  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.0322757  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1777  hypothetical protein  36.59 
 
 		 84 aa  52  0.000002  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.256897  normal  0.805615 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2603  hypothetical protein  37.88 
 
 		 80 aa  51.6  0.000003  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.355164  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2916  hypothetical protein  37.31 
 
 		 82 aa  51.6  0.000003  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.480647  normal  0.0883091 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2375  hypothetical protein  37.88 
 
 		 73 aa  51.2  0.000005  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.0792048  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3327  hypothetical protein  44.44 
 
 		 82 aa  50.8  0.000007  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.86974  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2643  hypothetical protein  41.79 
 
 		 79 aa  49.7  0.00001  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1958  hypothetical protein  35.53 
 
 		 80 aa  49.7  0.00001  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  decreased coverage  0.0000000000377235  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3433  hypothetical protein  37.14 
 
 		 77 aa  47.4  0.00007  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.14303  normal  1 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1209  hypothetical protein  43.14 
 
 		 86 aa  45.4  0.0003  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2416  hypothetical protein  30.38 
 
 		 123 aa  44.3  0.0005  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.82077  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4275  hypothetical protein  30.36 
 
 		 79 aa  43.1  0.001  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.532653  normal  0.601848 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0811  hypothetical protein  37.5 
 
 		 77 aa  42.7  0.002  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0949  hypothetical protein  30.26 
 
 		 80 aa  42  0.003  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  hitchhiker  0.0000000036055  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>