28 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Acry_3249 on replicon NC_009467
Organism: Acidiphilium cryptum JF-5



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009467  Acry_3249  hypothetical protein  100 
 
 
71 aa  146  8e-35  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.0322757  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1574  hypothetical protein  71.88 
 
 
82 aa  98.2  4e-20  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2917  hypothetical protein  67.16 
 
 
84 aa  97.8  4e-20  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.862357  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4037  hypothetical protein  64.06 
 
 
82 aa  96.3  1e-19  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal  0.0386053 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2916  hypothetical protein  65.15 
 
 
82 aa  94.4  5e-19  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.480647  normal  0.0883091 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1777  hypothetical protein  68.85 
 
 
84 aa  93.6  7e-19  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.256897  normal  0.805615 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3327  hypothetical protein  65.15 
 
 
82 aa  91.7  4e-18  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.86974  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2919  hypothetical protein  62.69 
 
 
179 aa  88.6  3e-17  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2375  hypothetical protein  67.8 
 
 
73 aa  87.4  6e-17  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.0792048  normal 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3433  hypothetical protein  54.24 
 
 
77 aa  75.5  0.0000000000002  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.14303  normal 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0811  hypothetical protein  61.82 
 
 
77 aa  73.9  0.0000000000006  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2432  hypothetical protein  55.36 
 
 
101 aa  67.8  0.00000000005  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009472  Acry_3623  hypothetical protein  52.17 
 
 
96 aa  65.9  0.0000000002  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1139  hypothetical protein  52.63 
 
 
102 aa  65.1  0.0000000003  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2869  hypothetical protein  46.27 
 
 
104 aa  63.2  0.000000001  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0127  hypothetical protein  55.36 
 
 
90 aa  63.5  0.000000001  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.00495666  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1907  hypothetical protein  50 
 
 
90 aa  57.4  0.00000006  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal  0.0497994 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2980  hypothetical protein  48.21 
 
 
89 aa  55.5  0.0000003  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4103  hypothetical protein  43.75 
 
 
78 aa  54.7  0.0000004  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.918286  normal 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1935  hypothetical protein  45.31 
 
 
90 aa  52.8  0.000001  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.795864  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1434  hypothetical protein  50 
 
 
85 aa  53.1  0.000001  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1231  hypothetical protein  45.31 
 
 
90 aa  52.8  0.000001  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2643  hypothetical protein  41.07 
 
 
79 aa  48.5  0.00003  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4275  hypothetical protein  41.07 
 
 
79 aa  46.2  0.0002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.532653  normal  0.601848 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1958  hypothetical protein  32.26 
 
 
80 aa  45.1  0.0003  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  decreased coverage  0.0000000000377235  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4993  hypothetical protein  33.33 
 
 
92 aa  45.1  0.0003  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.819538  normal  0.0403555 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4439  hypothetical protein  39.66 
 
 
147 aa  43.1  0.001  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2603  hypothetical protein  36.51 
 
 
80 aa  43.1  0.001  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.355164  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>