22 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Synpcc7942_1209 on replicon NC_007604
Organism: Synechococcus elongatus PCC 7942



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007604  Synpcc7942_1209  hypothetical protein  100 
 
 
86 aa  177  4.999999999999999e-44  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3483  hypothetical protein  39.73 
 
 
84 aa  71.2  0.000000000005  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1434  hypothetical protein  38.67 
 
 
85 aa  61.6  0.000000004  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2980  hypothetical protein  38.46 
 
 
89 aa  57.4  0.00000007  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2869  hypothetical protein  50.98 
 
 
104 aa  55.1  0.0000003  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0127  hypothetical protein  36.84 
 
 
90 aa  53.9  0.0000008  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.00495666  n/a   
 
 
-
 
NC_009472  Acry_3623  hypothetical protein  36.36 
 
 
96 aa  52  0.000002  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1139  hypothetical protein  43.14 
 
 
102 aa  51.6  0.000003  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4037  hypothetical protein  38.81 
 
 
82 aa  51.2  0.000005  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal  0.0386053 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1231  hypothetical protein  50.98 
 
 
90 aa  50.8  0.000006  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2643  hypothetical protein  36.99 
 
 
79 aa  50.4  0.000009  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2917  hypothetical protein  37.35 
 
 
84 aa  48.9  0.00002  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.862357  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4103  hypothetical protein  35.21 
 
 
78 aa  47.8  0.00005  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.918286  normal 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1907  hypothetical protein  45.1 
 
 
90 aa  46.2  0.0001  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal  0.0497994 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2916  hypothetical protein  38.46 
 
 
82 aa  45.1  0.0003  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.480647  normal  0.0883091 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1935  hypothetical protein  43.14 
 
 
90 aa  45.4  0.0003  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.795864  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2919  hypothetical protein  38.24 
 
 
179 aa  45.1  0.0003  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3327  hypothetical protein  38.46 
 
 
82 aa  44.3  0.0006  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.86974  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3433  hypothetical protein  31.82 
 
 
77 aa  43.9  0.0007  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.14303  normal 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1574  hypothetical protein  36.92 
 
 
82 aa  42  0.003  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1777  hypothetical protein  40.62 
 
 
84 aa  41.6  0.004  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.256897  normal  0.805615 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2432  hypothetical protein  31.43 
 
 
101 aa  40.8  0.006  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>