21 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rleg_6983 on replicon NC_012858
Organism: Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_012858  Rleg_6983  cobalt transporter, subunit CbtB  100 
 
 
62 aa  122  2e-27  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4713  cobalt transporter, subunit CbtB  64.52 
 
 
62 aa  81.6  0.000000000000004  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2776  cobalt transporter, subunit CbtB  54.24 
 
 
61 aa  62.8  0.000000002  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.0206473  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3100  cobalt transporter subunit CbtB, putative  50.77 
 
 
65 aa  61.6  0.000000004  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2355  cobalt transporter, subunit CbtB  59.57 
 
 
62 aa  61.2  0.000000004  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2533  cobalt transporter, subunit CbtB  59.57 
 
 
62 aa  60.8  0.000000006  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.718034  normal  0.011726 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3017  hypothetical protein  54.72 
 
 
60 aa  58.9  0.00000002  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.387145  normal  0.147919 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2216  cobalt transporter subunit CbtB  50.85 
 
 
60 aa  57.8  0.00000005  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.33529  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3774  cobalt transporter, subunit CbtB  45.9 
 
 
63 aa  56.6  0.0000001  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.39216  normal  0.336992 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3151  hypothetical protein  58.14 
 
 
61 aa  55.5  0.0000002  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0276034  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1273  hypothetical protein  37.1 
 
 
84 aa  48.9  0.00003  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.945783  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1310  hypothetical protein  37.1 
 
 
62 aa  48.1  0.00004  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.25175  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1873  cobalt transporter, subunit CbtB  37.29 
 
 
62 aa  47.4  0.00007  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.470545  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1444  cobalt transporter, subunit CbtB  55.56 
 
 
60 aa  45.4  0.0002  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal  0.314754 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1719  cobalt transporter, subunit CbtB  55.56 
 
 
60 aa  45.4  0.0002  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.299939  normal  0.0109308 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1441  cobalt transporter, subunit CbtB  54.05 
 
 
59 aa  43.9  0.0008  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.762364  normal  0.580122 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2302  hypothetical protein  54.55 
 
 
89 aa  43.1  0.001  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.238659  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2524  hypothetical protein  51.28 
 
 
58 aa  42.4  0.002  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2433  cobalt transporter, subunit CbtB  44.19 
 
 
58 aa  41.6  0.004  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.457129 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5842  hypothetical protein  34.85 
 
 
74 aa  41.2  0.005  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.470602  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2145  cobalt transporter, subunit CbtB  52.78 
 
 
58 aa  41.2  0.006  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.679719  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>