21 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mnod_2145 on replicon NC_011894
Organism: Methylobacterium nodulans ORS 2060



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011894  Mnod_2145  cobalt transporter, subunit CbtB  100 
 
 
58 aa  116  9.999999999999999e-26  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.679719  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_2433  cobalt transporter, subunit CbtB  74.14 
 
 
58 aa  89.4  2e-17  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.457129 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1719  cobalt transporter, subunit CbtB  67.39 
 
 
60 aa  69.7  0.00000000001  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.299939  normal  0.0109308 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1444  cobalt transporter, subunit CbtB  67.39 
 
 
60 aa  69.7  0.00000000001  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal  0.314754 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1441  cobalt transporter, subunit CbtB  65.22 
 
 
59 aa  67  0.00000000008  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.762364  normal  0.580122 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3111  cobalt transporter, subunit CbtB  66.13 
 
 
71 aa  60.1  0.000000009  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.0422011  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3100  cobalt transporter subunit CbtB, putative  49.12 
 
 
65 aa  55.8  0.0000002  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3017  hypothetical protein  56.82 
 
 
60 aa  55.1  0.0000003  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.387145  normal  0.147919 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3151  hypothetical protein  58.14 
 
 
61 aa  52.8  0.000002  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0276034  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2355  cobalt transporter, subunit CbtB  48 
 
 
62 aa  52.8  0.000002  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2533  cobalt transporter, subunit CbtB  48 
 
 
62 aa  52.8  0.000002  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.718034  normal  0.011726 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2776  cobalt transporter, subunit CbtB  48.98 
 
 
61 aa  52.4  0.000002  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.0206473  normal 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2524  hypothetical protein  52 
 
 
58 aa  50.1  0.00001  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2216  cobalt transporter subunit CbtB  50 
 
 
60 aa  48.5  0.00003  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.33529  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3774  cobalt transporter, subunit CbtB  42.62 
 
 
63 aa  47.8  0.00005  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.39216  normal  0.336992 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4713  cobalt transporter, subunit CbtB  50 
 
 
62 aa  44.7  0.0004  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1873  cobalt transporter, subunit CbtB  41.07 
 
 
62 aa  45.1  0.0004  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.470545  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1310  hypothetical protein  41.07 
 
 
62 aa  44.3  0.0006  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.25175  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1273  hypothetical protein  41.07 
 
 
84 aa  42.4  0.002  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.945783  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA2302  hypothetical protein  57.58 
 
 
89 aa  42  0.003  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.238659  n/a   
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_6983  cobalt transporter, subunit CbtB  52.78 
 
 
62 aa  41.2  0.005  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>