20 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene BR1310 on replicon NC_004310
Organism: Brucella suis 1330



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_004310  BR1310  hypothetical protein  100 
 
 		 62 aa  123  9e-28  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.25175  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1273  hypothetical protein  96.77 
 
 		 84 aa  118  1.9999999999999998e-26  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.945783  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1873  cobalt transporter, subunit CbtB  93.55 
 
 		 62 aa  115  1.9999999999999998e-25  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.470545  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2216  cobalt transporter subunit CbtB  53.45 
 
 		 60 aa  58.9  0.00000002  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.33529  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3100  cobalt transporter subunit CbtB, putative  48.21 
 
 		 65 aa  56.2  0.0000001  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3017  hypothetical protein  45.76 
 
 		 60 aa  52.4  0.000002  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.387145  normal  0.147919 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3151  hypothetical protein  53.49 
 
 		 61 aa  51.6  0.000004  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0276034  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2533  cobalt transporter, subunit CbtB  49.06 
 
 		 62 aa  51.2  0.000004  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.718034  normal  0.011726 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2355  cobalt transporter, subunit CbtB  49.06 
 
 		 62 aa  51.2  0.000005  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2776  cobalt transporter, subunit CbtB  50 
 
 		 61 aa  50.4  0.000009  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.0206473  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3774  cobalt transporter, subunit CbtB  50 
 
 		 63 aa  49.3  0.00002  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.39216  normal  0.336992 
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_6983  cobalt transporter, subunit CbtB  37.1 
 
 		 62 aa  48.1  0.00004  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2524  hypothetical protein  48.89 
 
 		 58 aa  47.8  0.00006  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4713  cobalt transporter, subunit CbtB  42.22 
 
 		 62 aa  45.1  0.0003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2145  cobalt transporter, subunit CbtB  41.07 
 
 		 58 aa  44.3  0.0007  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.679719  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1444  cobalt transporter, subunit CbtB  44.74 
 
 		 60 aa  42  0.003  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.314754 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2302  hypothetical protein  54.55 
 
 		 89 aa  42  0.003  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.238659  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1441  cobalt transporter, subunit CbtB  44.74 
 
 		 59 aa  41.6  0.003  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.762364  normal  0.580122 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1719  cobalt transporter, subunit CbtB  44.74 
 
 		 60 aa  42  0.003  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.299939  normal  0.0109308 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2433  cobalt transporter, subunit CbtB  44.19 
 
 		 58 aa  41.2  0.004  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.457129 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>