20 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pden_2524 on replicon NC_008686
Organism: Paracoccus denitrificans PD1222



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008686  Pden_2524  hypothetical protein  100 
 
 		 58 aa  116  9.999999999999999e-26  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1719  cobalt transporter, subunit CbtB  60.53 
 
 		 60 aa  50.4  0.000008  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.299939  normal  0.0109308 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1444  cobalt transporter, subunit CbtB  60.53 
 
 		 60 aa  50.4  0.000008  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.314754 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1873  cobalt transporter, subunit CbtB  51.11 
 
 		 62 aa  50.4  0.000009  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.470545  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2145  cobalt transporter, subunit CbtB  52 
 
 		 58 aa  50.1  0.00001  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.679719  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_2433  cobalt transporter, subunit CbtB  48.28 
 
 		 58 aa  50.1  0.00001  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.457129 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1441  cobalt transporter, subunit CbtB  60.53 
 
 		 59 aa  49.3  0.00002  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.762364  normal  0.580122 
 
 
-
 
NC_004310  BR1310  hypothetical protein  48.89 
 
 		 62 aa  47.8  0.00006  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.25175  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1273  hypothetical protein  48.89 
 
 		 84 aa  45.4  0.0003  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.945783  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2776  cobalt transporter, subunit CbtB  48.72 
 
 		 61 aa  45.1  0.0004  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.0206473  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2355  cobalt transporter, subunit CbtB  46.15 
 
 		 62 aa  44.3  0.0005  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3100  cobalt transporter subunit CbtB, putative  45.24 
 
 		 65 aa  44.7  0.0005  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2533  cobalt transporter, subunit CbtB  46.15 
 
 		 62 aa  44.3  0.0005  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.718034  normal  0.011726 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2216  cobalt transporter subunit CbtB  43.59 
 
 		 60 aa  43.5  0.001  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.33529  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3017  hypothetical protein  37.25 
 
 		 60 aa  43.1  0.001  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.387145  normal  0.147919 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4713  cobalt transporter, subunit CbtB  42.59 
 
 		 62 aa  43.5  0.001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_6983  cobalt transporter, subunit CbtB  51.28 
 
 		 62 aa  42.4  0.002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0162  hypothetical protein  72 
 
 		 65 aa  41.2  0.005  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.371596  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3151  hypothetical protein  40.48 
 
 		 61 aa  40.4  0.008  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0276034  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3774  cobalt transporter, subunit CbtB  43.1 
 
 		 63 aa  40  0.01  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.39216  normal  0.336992 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>