21 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PputGB1_2533 on replicon NC_010322
Organism: Pseudomonas putida GB-1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010322  PputGB1_2533  cobalt transporter, subunit CbtB  100 
 
 		 62 aa  125  1.0000000000000001e-28  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.718034  normal  0.011726 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2355  cobalt transporter, subunit CbtB  98.39 
 
 		 62 aa  125  2.0000000000000002e-28  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2776  cobalt transporter, subunit CbtB  88.71 
 
 		 61 aa  109  1.0000000000000001e-23  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.0206473  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3100  cobalt transporter subunit CbtB, putative  71.19 
 
 		 65 aa  89.7  1e-17  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3017  hypothetical protein  65 
 
 		 60 aa  82.4  0.000000000000002  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.387145  normal  0.147919 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2216  cobalt transporter subunit CbtB  66.1 
 
 		 60 aa  80.9  0.000000000000005  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.33529  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3151  hypothetical protein  81.4 
 
 		 61 aa  75.9  0.0000000000002  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0276034  n/a   
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_6983  cobalt transporter, subunit CbtB  59.57 
 
 		 62 aa  60.8  0.000000006  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4713  cobalt transporter, subunit CbtB  75 
 
 		 62 aa  59.7  0.00000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3774  cobalt transporter, subunit CbtB  46.77 
 
 		 63 aa  53.9  0.0000006  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.39216  normal  0.336992 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2145  cobalt transporter, subunit CbtB  48 
 
 		 58 aa  52.8  0.000002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.679719  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1873  cobalt transporter, subunit CbtB  49.06 
 
 		 62 aa  52  0.000003  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.470545  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1273  hypothetical protein  49.06 
 
 		 84 aa  52  0.000003  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.945783  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1310  hypothetical protein  49.06 
 
 		 62 aa  51.2  0.000004  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.25175  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_2433  cobalt transporter, subunit CbtB  46.94 
 
 		 58 aa  49.7  0.00001  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.457129 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2302  hypothetical protein  66.67 
 
 		 89 aa  48.1  0.00004  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.238659  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1444  cobalt transporter, subunit CbtB  58.33 
 
 		 60 aa  47.4  0.00006  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.314754 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1719  cobalt transporter, subunit CbtB  58.33 
 
 		 60 aa  47.4  0.00006  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.299939  normal  0.0109308 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1441  cobalt transporter, subunit CbtB  58.33 
 
 		 59 aa  46.6  0.0001  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.762364  normal  0.580122 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2524  hypothetical protein  46.15 
 
 		 58 aa  44.3  0.0005  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3111  cobalt transporter, subunit CbtB  53.33 
 
 		 71 aa  41.2  0.005  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.0422011  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>