32 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rleg_0538 on replicon NC_012850
Organism: Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_012850  Rleg_0538  hypothetical protein  100 
 
 
76 aa  160  6e-39  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.343619  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0495  hypothetical protein  98.68 
 
 
76 aa  159  1e-38  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.0716845  normal  0.367929 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0427  hypothetical protein  65.33 
 
 
77 aa  113  7.999999999999999e-25  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.130154  normal  0.629001 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0896  hypothetical protein  64.47 
 
 
76 aa  112  2.0000000000000002e-24  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.0763805  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0440  hypothetical protein  59.21 
 
 
75 aa  96.3  1e-19  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.628612  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3048  hypothetical protein  53.33 
 
 
100 aa  83.6  8e-16  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0197  hypothetical protein  56.92 
 
 
105 aa  83.2  0.000000000000001  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA0217  hypothetical protein  64.91 
 
 
78 aa  83.2  0.000000000000001  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_4107  hypothetical protein  56.45 
 
 
75 aa  81.6  0.000000000000004  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1351  hypothetical protein  62.5 
 
 
75 aa  81.6  0.000000000000004  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.26677  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1857  hypothetical protein  51.39 
 
 
75 aa  80.5  0.000000000000006  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal  0.0152873 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4703  hypothetical protein  59.65 
 
 
73 aa  76.6  0.00000000000009  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.4502  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1693  hypothetical protein  60.71 
 
 
75 aa  76.3  0.0000000000001  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.459273  normal 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3176  hypothetical protein  58.93 
 
 
75 aa  75.9  0.0000000000002  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.258914  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2554  hypothetical protein  58.93 
 
 
119 aa  75.1  0.0000000000003  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.234131  normal  0.985224 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1414  hypothetical protein  63.33 
 
 
74 aa  75.1  0.0000000000003  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3147  hypothetical protein  50 
 
 
65 aa  72.4  0.000000000002  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.853327  normal  0.88772 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7566  hypothetical protein  53.57 
 
 
72 aa  68.2  0.00000000003  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_3106  hypothetical protein  52.63 
 
 
70 aa  67  0.00000000007  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.473325  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3150  hypothetical protein  49.23 
 
 
74 aa  67  0.00000000008  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0887  hypothetical protein  44.93 
 
 
72 aa  66.2  0.0000000001  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal  0.0136649 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0621  hypothetical protein  51.79 
 
 
72 aa  65.5  0.0000000002  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0073  hypothetical protein  59.57 
 
 
73 aa  65.9  0.0000000002  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.22688 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2968  hypothetical protein  47.69 
 
 
74 aa  64.7  0.0000000004  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.0599304  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3194  hypothetical protein  47.69 
 
 
74 aa  64.7  0.0000000004  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.0939257  normal  0.28104 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6830  hypothetical protein  55.1 
 
 
72 aa  62.8  0.000000002  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0170  hypothetical protein  56.25 
 
 
67 aa  62.4  0.000000002  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0917  hypothetical protein  56.52 
 
 
73 aa  61.6  0.000000004  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.77246  normal  0.130271 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1225  hypothetical protein  44.62 
 
 
73 aa  59.7  0.00000001  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.0616063 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_1202  hypothetical protein  48.94 
 
 
77 aa  58.5  0.00000003  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  0.836784  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0629  hypothetical protein  48.28 
 
 
76 aa  58.2  0.00000004  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal  0.0862057 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4404  hypothetical protein  50.94 
 
 
73 aa  54.3  0.0000005  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.555767  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>