32 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene BBta_1693 on replicon NC_009485
Organism: Bradyrhizobium sp. BTAi1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009485  BBta_1693  hypothetical protein  100 
 
 
75 aa  157  7e-38  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.459273  normal 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3176  hypothetical protein  95.89 
 
 
75 aa  147  7e-35  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.258914  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2554  hypothetical protein  87.84 
 
 
119 aa  140  7e-33  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.234131  normal  0.985224 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1857  hypothetical protein  82.67 
 
 
75 aa  132  1.9999999999999998e-30  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal  0.0152873 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4703  hypothetical protein  83.33 
 
 
73 aa  130  6.999999999999999e-30  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.4502  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_4107  hypothetical protein  84.72 
 
 
75 aa  129  1.0000000000000001e-29  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1351  hypothetical protein  80.56 
 
 
75 aa  124  4.0000000000000003e-28  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.26677  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1414  hypothetical protein  65.67 
 
 
74 aa  95.1  3e-19  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0917  hypothetical protein  64.52 
 
 
73 aa  88.2  3e-17  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.77246  normal  0.130271 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7566  hypothetical protein  60 
 
 
72 aa  84.7  4e-16  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0621  hypothetical protein  57.81 
 
 
72 aa  82  0.000000000000002  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6830  hypothetical protein  58.46 
 
 
72 aa  81.3  0.000000000000004  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3150  hypothetical protein  59.7 
 
 
74 aa  81.3  0.000000000000004  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0073  hypothetical protein  59.32 
 
 
73 aa  80.9  0.000000000000005  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.22688 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3194  hypothetical protein  58.21 
 
 
74 aa  80.1  0.00000000000001  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.0939257  normal  0.28104 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2968  hypothetical protein  58.21 
 
 
74 aa  80.1  0.00000000000001  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.0599304  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0887  hypothetical protein  55.38 
 
 
72 aa  79  0.00000000000002  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal  0.0136649 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0440  hypothetical protein  53.85 
 
 
75 aa  77  0.00000000000007  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.628612  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0495  hypothetical protein  60.71 
 
 
76 aa  76.6  0.0000000000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.0716845  normal  0.367929 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0538  hypothetical protein  60.71 
 
 
76 aa  76.3  0.0000000000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.343619  normal 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0896  hypothetical protein  55.56 
 
 
76 aa  76.3  0.0000000000001  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.0763805  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0427  hypothetical protein  51.56 
 
 
77 aa  75.1  0.0000000000003  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.130154  normal  0.629001 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3048  hypothetical protein  58.93 
 
 
100 aa  73.2  0.000000000001  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0197  hypothetical protein  57.14 
 
 
105 aa  70.9  0.000000000006  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA0217  hypothetical protein  57.14 
 
 
78 aa  70.5  0.000000000007  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1225  hypothetical protein  50.75 
 
 
73 aa  68.9  0.00000000002  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.0616063 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0629  hypothetical protein  49.18 
 
 
76 aa  62.8  0.000000001  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal  0.0862057 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0170  hypothetical protein  47.37 
 
 
67 aa  60.8  0.000000006  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3147  hypothetical protein  59.09 
 
 
65 aa  57.4  0.00000007  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.853327  normal  0.88772 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_1202  hypothetical protein  40.68 
 
 
77 aa  55.8  0.0000002  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  0.836784  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_3106  hypothetical protein  47.54 
 
 
70 aa  54.7  0.0000004  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.473325  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4404  hypothetical protein  53.19 
 
 
73 aa  53.5  0.000001  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.555767  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>