32 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene M446_6830 on replicon NC_010511
Organism: Methylobacterium sp. 4-46



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010511  M446_6830  hypothetical protein  100 
 
 
72 aa  145  2.0000000000000003e-34  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7566  hypothetical protein  90.28 
 
 
72 aa  133  6.0000000000000005e-31  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0887  hypothetical protein  70.83 
 
 
72 aa  110  6e-24  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal  0.0136649 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3194  hypothetical protein  74.65 
 
 
74 aa  105  3e-22  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.0939257  normal  0.28104 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2968  hypothetical protein  74.65 
 
 
74 aa  105  3e-22  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.0599304  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3150  hypothetical protein  73.24 
 
 
74 aa  104  5e-22  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0917  hypothetical protein  61.9 
 
 
73 aa  85.1  3e-16  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.77246  normal  0.130271 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_4107  hypothetical protein  56.92 
 
 
75 aa  84.3  5e-16  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1857  hypothetical protein  56.92 
 
 
75 aa  82.8  0.000000000000001  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal  0.0152873 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1414  hypothetical protein  58.57 
 
 
74 aa  82.8  0.000000000000001  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1351  hypothetical protein  55.38 
 
 
75 aa  82.8  0.000000000000001  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.26677  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3176  hypothetical protein  58.46 
 
 
75 aa  81.6  0.000000000000003  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.258914  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4703  hypothetical protein  55.38 
 
 
73 aa  81.3  0.000000000000004  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.4502  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1693  hypothetical protein  58.46 
 
 
75 aa  81.3  0.000000000000004  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.459273  normal 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2554  hypothetical protein  55.38 
 
 
119 aa  79  0.00000000000002  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.234131  normal  0.985224 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0621  hypothetical protein  53.73 
 
 
72 aa  74.3  0.0000000000005  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0073  hypothetical protein  53.97 
 
 
73 aa  73.6  0.0000000000009  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.22688 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1225  hypothetical protein  53.33 
 
 
73 aa  71.6  0.000000000003  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.0616063 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0629  hypothetical protein  48.48 
 
 
76 aa  68.9  0.00000000002  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal  0.0862057 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0440  hypothetical protein  50 
 
 
75 aa  68.2  0.00000000004  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.628612  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA0217  hypothetical protein  52.63 
 
 
78 aa  67.4  0.00000000006  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0197  hypothetical protein  52.63 
 
 
105 aa  66.6  0.0000000001  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0896  hypothetical protein  40.58 
 
 
76 aa  64.3  0.0000000005  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.0763805  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0427  hypothetical protein  44.29 
 
 
77 aa  63.9  0.0000000006  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.130154  normal  0.629001 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3048  hypothetical protein  50 
 
 
100 aa  63.9  0.0000000007  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0495  hypothetical protein  55.1 
 
 
76 aa  62.8  0.000000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.0716845  normal  0.367929 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0538  hypothetical protein  55.1 
 
 
76 aa  62.8  0.000000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.343619  normal 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_3106  hypothetical protein  58 
 
 
70 aa  61.6  0.000000003  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.473325  normal 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_1202  hypothetical protein  42.37 
 
 
77 aa  59.3  0.00000002  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  0.836784  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4404  hypothetical protein  51.06 
 
 
73 aa  52.8  0.000001  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.555767  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3147  hypothetical protein  59.52 
 
 
65 aa  52.4  0.000002  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.853327  normal  0.88772 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0170  hypothetical protein  44.64 
 
 
67 aa  46.2  0.0001  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>