32 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene RPB_1857 on replicon NC_007778
Organism: Rhodopseudomonas palustris HaA2



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007778  RPB_1857  hypothetical protein  100 
 
 		 75 aa  157  6e-38  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.0152873 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_4107  hypothetical protein  95.95 
 
 		 75 aa  150  7e-36  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4703  hypothetical protein  91.67 
 
 		 73 aa  139  9e-33  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.4502  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1351  hypothetical protein  89.04 
 
 		 75 aa  135  2e-31  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.26677  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1693  hypothetical protein  82.67 
 
 		 75 aa  132  1.9999999999999998e-30  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.459273  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3176  hypothetical protein  83.33 
 
 		 75 aa  127  4.0000000000000003e-29  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.258914  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2554  hypothetical protein  79.17 
 
 		 119 aa  122  2e-27  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.234131  normal  0.985224 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1414  hypothetical protein  64.18 
 
 		 74 aa  95.1  3e-19  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0917  hypothetical protein  60.87 
 
 		 73 aa  91.7  3e-18  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.77246  normal  0.130271 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7566  hypothetical protein  63.08 
 
 		 72 aa  90.9  5e-18  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3150  hypothetical protein  62.69 
 
 		 74 aa  85.1  3e-16  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3194  hypothetical protein  61.19 
 
 		 74 aa  83.6  9e-16  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.0939257  normal  0.28104 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2968  hypothetical protein  61.19 
 
 		 74 aa  83.6  9e-16  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.0599304  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6830  hypothetical protein  56.92 
 
 		 72 aa  82.8  0.000000000000001  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0073  hypothetical protein  53.03 
 
 		 73 aa  82.4  0.000000000000002  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.22688 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0495  hypothetical protein  51.39 
 
 		 76 aa  81.6  0.000000000000003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.0716845  normal  0.367929 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0621  hypothetical protein  56.25 
 
 		 72 aa  81.6  0.000000000000004  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0538  hypothetical protein  51.39 
 
 		 76 aa  80.5  0.000000000000007  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.343619  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0887  hypothetical protein  53.85 
 
 		 72 aa  79.7  0.00000000000001  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.0136649 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0440  hypothetical protein  53.03 
 
 		 75 aa  79.3  0.00000000000002  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.628612  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3048  hypothetical protein  53.03 
 
 		 100 aa  78.6  0.00000000000003  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0427  hypothetical protein  51.56 
 
 		 77 aa  77.8  0.00000000000005  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.130154  normal  0.629001 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0896  hypothetical protein  50 
 
 		 76 aa  77.4  0.00000000000006  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.0763805  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0197  hypothetical protein  48.48 
 
 		 105 aa  74.3  0.0000000000005  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA0217  hypothetical protein  48.48 
 
 		 78 aa  74.3  0.0000000000005  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1225  hypothetical protein  49.25 
 
 		 73 aa  68.6  0.00000000003  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.0616063 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0629  hypothetical protein  42.03 
 
 		 76 aa  63.9  0.0000000008  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  0.0862057 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0170  hypothetical protein  48.21 
 
 		 67 aa  62  0.000000002  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_3106  hypothetical protein  51.72 
 
 		 70 aa  60.5  0.000000007  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.473325  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3147  hypothetical protein  51.02 
 
 		 65 aa  58.5  0.00000003  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.853327  normal  0.88772 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_1202  hypothetical protein  38.46 
 
 		 77 aa  57  0.0000001  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  0.836784  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4404  hypothetical protein  51.06 
 
 		 73 aa  53.5  0.000001  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.555767  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>