15 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Reut_A2039 on replicon NC_007347
Organism: Ralstonia eutropha JMP134



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007347  Reut_A2039  cytochrome C oxidase subunit  100 
 
 		 54 aa  114  5e-25  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0319707  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2042  cytochrome c oxidase subunit  79.25 
 
 		 55 aa  86.3  1e-16  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0208839  normal  1 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0455  hypothetical protein  69.05 
 
 		 61 aa  66.6  0.0000000001  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1361  hypothetical protein  60.42 
 
 		 55 aa  62.8  0.000000002  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  1  normal  0.281945 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1199  putative signal peptide protein  57.69 
 
 		 60 aa  60.8  0.000000006  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.329097  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1106  conserved hypothetical signal peptide protein  57.69 
 
 		 60 aa  60.5  0.000000007  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.0675956  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1278  putative signal peptide protein  53.85 
 
 		 60 aa  59.7  0.00000001  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.687203 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003469  cytochrome c oxidase subunit CcoQ  45.1 
 
 		 57 aa  45.1  0.0003  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.274679  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1786  Cbb3-type cytochrome oxidase component  46.51 
 
 		 61 aa  44.7  0.0005  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.569607  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0641  cytochrome c oxidase, subunit CcoQ  39.53 
 
 		 54 aa  42.4  0.002  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  hitchhiker  0.000266851  normal  0.653768 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4303  Cbb3-type cytochrome oxidase component  53.12 
 
 		 45 aa  41.6  0.003  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.0280822  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1525  Cbb3-type cytochrome oxidase component  50 
 
 		 59 aa  41.2  0.005  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.558646  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_44390  putative cytochrome c oxidase subunit  43.9 
 
 		 64 aa  40.4  0.009  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3779  cbb3-type cytochrome c oxidase subunit CcoQ  43.9 
 
 		 61 aa  40.4  0.009  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1279  Cbb3-type cytochrome oxidase component  43.59 
 
 		 62 aa  40  0.01  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>