15 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene RSc3434 on replicon NC_003295
Organism: Ralstonia solanacearum GMI1000



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_003295  RSc3434  hypothetical protein  100 
 
 		 86 aa  181  2.0000000000000003e-45  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_3259  hypothetical protein  50.59 
 
 		 122 aa  90.1  9e-18  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3449  hypothetical protein  47.06 
 
 		 122 aa  85.1  3e-16  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_3105  hypothetical protein  47.06 
 
 		 121 aa  85.1  3e-16  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3583  hypothetical protein  48.24 
 
 		 122 aa  84.7  4e-16  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.881264 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0009  hypothetical protein  45.88 
 
 		 122 aa  84  6e-16  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0007  hypothetical protein  45.88 
 
 		 122 aa  83.6  9e-16  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.303674  normal  1 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4118  hypothetical protein  45.88 
 
 		 90 aa  78.6  0.00000000000003  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.457314  normal  0.0301059 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3635  hypothetical protein  43.53 
 
 		 94 aa  78.2  0.00000000000003  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_3310  hypothetical protein  43.53 
 
 		 94 aa  78.2  0.00000000000003  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4230  hypothetical protein  45.88 
 
 		 90 aa  78.6  0.00000000000003  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.207721  normal  1 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_3875  hypothetical protein  37.5 
 
 		 92 aa  70.1  0.000000000008  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.228714 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3989  hypothetical protein  37.5 
 
 		 92 aa  70.1  0.000000000008  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1294  hypothetical protein  40.7 
 
 		 87 aa  57.8  0.00000005  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.218039  normal  0.118522 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1231  hypothetical protein  39.53 
 
 		 99 aa  57.4  0.00000006  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>