13 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rpic_3875 on replicon NC_010678
Organism: Ralstonia pickettii 12J



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010678  Rpic_3875  hypothetical protein  100 
 
 		 92 aa  191  3e-48  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.228714 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3989  hypothetical protein  100 
 
 		 92 aa  191  3e-48  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc3434  hypothetical protein  37.5 
 
 		 86 aa  70.1  0.000000000009  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1231  hypothetical protein  39.51 
 
 		 99 aa  58.2  0.00000004  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1294  hypothetical protein  39.51 
 
 		 87 aa  57.8  0.00000006  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.218039  normal  0.118522 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_3259  hypothetical protein  38.55 
 
 		 122 aa  57  0.00000009  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3449  hypothetical protein  39.29 
 
 		 122 aa  53.5  0.0000009  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0009  hypothetical protein  39.29 
 
 		 122 aa  53.5  0.000001  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_3105  hypothetical protein  39.29 
 
 		 121 aa  53.1  0.000001  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0007  hypothetical protein  39.29 
 
 		 122 aa  52.8  0.000002  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.303674  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3583  hypothetical protein  39.29 
 
 		 122 aa  51.6  0.000004  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.881264 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3635  hypothetical protein  33.71 
 
 		 94 aa  47  0.00009  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_3310  hypothetical protein  33.71 
 
 		 94 aa  47  0.00009  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>