25 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene RSP_4040 on replicon NC_007488
Organism: Rhodobacter sphaeroides 2.4.1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007489  RSP_4137    100 
 
 
330 bp  654    Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2865  putative transposase  100 
 
 
1380 bp  1524    Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3937  transposase protein, Y4bF  100 
 
 
1377 bp  1524    Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007488  RSP_4040    100 
 
 
801 bp  1588    Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009007  RSP_7365    99.8 
 
 
507 bp  991    Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  hitchhiker  0.000000311947  n/a   
 
 
-
 
NC_007489  RSP_7258    99.36 
 
 
921 bp  599  1e-169  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009008  RSP_7360  integrase catalytic subunit  97.48 
 
 
1020 bp  460  1e-127  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.0181906  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3280  integrase catalytic subunit  84.73 
 
 
954 bp  202  1.0000000000000001e-49  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.583833  normal  0.0175865 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2654  integrase catalytic region  84.35 
 
 
1299 bp  109  1e-21  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.268588 
 
 
-
 
NC_011371  Rleg2_6382  Integrase catalytic region  81.63 
 
 
1374 bp  103  8e-20  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.583373 
 
 
-
 
NC_011370  Rleg2_6234  Integrase catalytic region  81.63 
 
 
1374 bp  103  8e-20  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.416646 
 
 
-
 
NC_009508  Swit_5014    86.6 
 
 
1418 bp  89.7  0.000000000000001  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal  0.179514 
 
 
-
 
NC_007959  Nham_4092  integrase catalytic subunit  83.21 
 
 
1296 bp  89.7  0.000000000000001  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010335  Caul_5238  integrase catalytic region  81.88 
 
 
1299 bp  81.8  0.0000000000003  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1967  Integrase catalytic region  80 
 
 
1374 bp  77.8  0.000000000004  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.227669  normal  0.536368 
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_5282  Integrase catalytic region  79.49 
 
 
1374 bp  69.9  0.000000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1989  integrase catalytic subunit  85 
 
 
1395 bp  63.9  0.00000007  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.0157211  normal 
 
 
-
 
NC_008760  Pnap_4735  integrase catalytic subunit  85 
 
 
1395 bp  63.9  0.00000007  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011370  Rleg2_6235  Integrase catalytic region  85.71 
 
 
1428 bp  60  0.000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.782279  normal  0.38936 
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_5284  Integrase catalytic region  82.18 
 
 
1425 bp  58  0.000004  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1969  Integrase catalytic region  82.18 
 
 
1425 bp  58  0.000004  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.233913  normal  0.387035 
 
 
-
 
NC_012852  Rleg_6205  Integrase catalytic region  82.18 
 
 
1425 bp  58  0.000004  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.480184 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0670  putative transposase  86.44 
 
 
1389 bp  54  0.00006  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0369159  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3038  integrase catalytic subunit  80.16 
 
 
1254 bp  52  0.0003  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.158166  n/a   
 
 
-
 
NC_010627  Bphy_7317  integrase catalytic region  85.71 
 
 
1125 bp  48.1  0.004  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.599541  normal  0.0472875 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>