18 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene RPD_3442 on replicon NC_007958
Organism: Rhodopseudomonas palustris BisB5



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007958  RPD_3442  hypothetical protein  100 
 
 		 81 aa  167  4e-41  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.180777  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2151  hypothetical protein  77.5 
 
 		 91 aa  117  6e-26  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.0506986 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2680  hypothetical protein  59.49 
 
 		 79 aa  87  9e-17  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.366173  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0709  hypothetical protein  62.34 
 
 		 79 aa  86.7  1e-16  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.769929  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2730  hypothetical protein  50.63 
 
 		 93 aa  86.3  1e-16  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.122577  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2991  hypothetical protein  50.63 
 
 		 95 aa  86.3  1e-16  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.32284  normal  0.0728404 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0363  hypothetical protein  60.76 
 
 		 80 aa  85.9  2e-16  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0394  hypothetical protein  64.38 
 
 		 80 aa  84.7  4e-16  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.0799008  normal  0.331477 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0318  hypothetical protein  59.49 
 
 		 80 aa  84  6e-16  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.770839  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1816  hypothetical protein  58.23 
 
 		 79 aa  80.9  0.000000000000006  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.23944 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_3838  hypothetical protein  55.7 
 
 		 187 aa  77  0.00000000000007  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.0103581  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1383  hypothetical protein  51.9 
 
 		 80 aa  74.7  0.0000000000004  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.0800623  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3146  hypothetical protein  43.04 
 
 		 87 aa  72.4  0.000000000002  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1685  hypothetical protein  46.75 
 
 		 99 aa  71.6  0.000000000003  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012853  Rleg_5626  hypothetical protein  46.25 
 
 		 81 aa  66.6  0.0000000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.550605 
 
 
-
 
NC_012852  Rleg_6007  hypothetical protein  47.5 
 
 		 81 aa  66.2  0.0000000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0277  hypothetical protein  40 
 
 		 77 aa  47.8  0.00006  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0308  hypothetical protein  40 
 
 		 77 aa  47.4  0.00007  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>