18 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Avi_3146 on replicon NC_011989
Organism: Agrobacterium vitis S4



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011989  Avi_3146  hypothetical protein  100 
 
 		 87 aa  180  6e-45  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2730  hypothetical protein  54.02 
 
 		 93 aa  99  2e-20  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.122577  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2991  hypothetical protein  54.02 
 
 		 95 aa  97.4  5e-20  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.32284  normal  0.0728404 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3442  hypothetical protein  43.04 
 
 		 81 aa  67.8  0.00000000005  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.180777  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0709  hypothetical protein  45.45 
 
 		 79 aa  67  0.00000000008  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.769929  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1383  hypothetical protein  46.84 
 
 		 80 aa  67  0.00000000009  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.0800623  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1816  hypothetical protein  45.57 
 
 		 79 aa  64.3  0.0000000005  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.23944 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2151  hypothetical protein  43.04 
 
 		 91 aa  59.7  0.00000001  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.0506986 
 
 
-
 
NC_012852  Rleg_6007  hypothetical protein  39.24 
 
 		 81 aa  56.2  0.0000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012853  Rleg_5626  hypothetical protein  37.97 
 
 		 81 aa  54.3  0.0000006  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.550605 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2680  hypothetical protein  39.24 
 
 		 79 aa  51.6  0.000004  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.366173  normal  1 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_3838  hypothetical protein  37.97 
 
 		 187 aa  51.6  0.000004  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.0103581  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1685  hypothetical protein  35.06 
 
 		 99 aa  50.4  0.000007  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0363  hypothetical protein  39.24 
 
 		 80 aa  50.1  0.00001  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0394  hypothetical protein  42.47 
 
 		 80 aa  49.3  0.00002  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.0799008  normal  0.331477 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0318  hypothetical protein  37.97 
 
 		 80 aa  47.8  0.00006  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.770839  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0277  hypothetical protein  34.43 
 
 		 77 aa  45.8  0.0002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0308  hypothetical protein  32.79 
 
 		 77 aa  44.3  0.0006  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>