18 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Meso_1685 on replicon NC_008254
Organism: Chelativorans sp. BNC1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008254  Meso_1685  hypothetical protein  100 
 
 
99 aa  199  7e-51  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2730  hypothetical protein  50.65 
 
 
93 aa  81.6  0.000000000000004  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.122577  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2151  hypothetical protein  53.25 
 
 
91 aa  80.5  0.000000000000008  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal  0.0506986 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2991  hypothetical protein  49.35 
 
 
95 aa  80.5  0.000000000000008  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.32284  normal  0.0728404 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0709  hypothetical protein  51.28 
 
 
79 aa  78.2  0.00000000000003  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.769929  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2680  hypothetical protein  57.14 
 
 
79 aa  77.8  0.00000000000005  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.366173  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0318  hypothetical protein  55.84 
 
 
80 aa  75.5  0.0000000000002  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.770839  normal 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_3838  hypothetical protein  57.14 
 
 
187 aa  74.7  0.0000000000003  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.0103581  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0394  hypothetical protein  57.14 
 
 
80 aa  74.3  0.0000000000005  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.0799008  normal  0.331477 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0363  hypothetical protein  55.84 
 
 
80 aa  74.3  0.0000000000006  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3442  hypothetical protein  46.75 
 
 
81 aa  70.1  0.00000000001  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.180777  normal 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1383  hypothetical protein  46.15 
 
 
80 aa  64.3  0.0000000005  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.0800623  normal 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1816  hypothetical protein  45.45 
 
 
79 aa  58.9  0.00000003  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.23944 
 
 
-
 
NC_012853  Rleg_5626  hypothetical protein  45.45 
 
 
81 aa  58.2  0.00000004  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.550605 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3146  hypothetical protein  35.06 
 
 
87 aa  56.2  0.0000001  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012852  Rleg_6007  hypothetical protein  45.45 
 
 
81 aa  56.2  0.0000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0308  hypothetical protein  41.1 
 
 
77 aa  55.5  0.0000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0277  hypothetical protein  40.54 
 
 
77 aa  55.1  0.0000004  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>