21 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene RPD_1420 on replicon NC_007958
Organism: Rhodopseudomonas palustris BisB5



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007958  RPD_1420  cupin 2, barrel  100 
 
 		 95 aa  194  3e-49  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.809174  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1440  hypothetical protein  87.23 
 
 		 95 aa  175  2e-43  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.997199 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4658  hypothetical protein  78.72 
 
 		 95 aa  161  4.0000000000000004e-39  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.768607  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3964  cupin 2, barrel  75.53 
 
 		 95 aa  157  6e-38  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.0415147  normal  0.762115 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6852  hypothetical protein  79.17 
 
 		 73 aa  118  3e-26  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.657654  normal  0.286237 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_01610  hypothetical protein  61.63 
 
 		 95 aa  111  4.0000000000000004e-24  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.522727  normal  0.697897 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0207  hypothetical protein  60.47 
 
 		 95 aa  107  4.0000000000000004e-23  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.731154  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0412  hypothetical protein  51.65 
 
 		 94 aa  99.8  1e-20  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4250  hypothetical protein  51.11 
 
 		 94 aa  97.4  6e-20  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.41432  normal  0.497138 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1619  hypothetical protein  51.16 
 
 		 99 aa  93.6  9e-19  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.476859  normal  1 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7511  hypothetical protein  51.19 
 
 		 95 aa  84.3  5e-16  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.860048 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3900  cupin 2 domain-containing protein  43.62 
 
 		 108 aa  81.6  0.000000000000004  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.487212 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1491  Cupin 2 conserved barrel domain protein  45.74 
 
 		 102 aa  79  0.00000000000002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1128  hypothetical protein  44.44 
 
 		 98 aa  78.2  0.00000000000004  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2708  cupin 2 protein  43.33 
 
 		 93 aa  77.4  0.00000000000007  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.126395  normal  0.479174 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0685  cupin 2 domain-containing protein  46.81 
 
 		 102 aa  77  0.00000000000009  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.419495 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3881  hypothetical protein  32.95 
 
 		 100 aa  44.7  0.0005  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4272  hypothetical protein  32.95 
 
 		 100 aa  44.3  0.0005  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.0273731  hitchhiker  0.00830783 
 
 
-
 
NC_006369  lpl0661  hypothetical protein  33.73 
 
 		 125 aa  43.9  0.0008  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp0678  hypothetical protein  36.62 
 
 		 125 aa  42  0.003  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3895  hypothetical protein  28.89 
 
 		 113 aa  42  0.003  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.18342 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>