17 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Avi_1128 on replicon NC_011989
Organism: Agrobacterium vitis S4



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011989  Avi_1128  hypothetical protein  100 
 
 		 98 aa  202  1e-51  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2708  cupin 2 protein  60 
 
 		 93 aa  102  1e-21  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.126395  normal  0.479174 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0207  hypothetical protein  54.26 
 
 		 95 aa  99.4  2e-20  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.731154  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_01610  hypothetical protein  51.06 
 
 		 95 aa  96.3  1e-19  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.522727  normal  0.697897 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0412  hypothetical protein  50.55 
 
 		 94 aa  93.6  7e-19  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1491  Cupin 2 conserved barrel domain protein  44.79 
 
 		 102 aa  89.7  1e-17  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3900  cupin 2 domain-containing protein  44.79 
 
 		 108 aa  88.6  2e-17  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.487212 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0685  cupin 2 domain-containing protein  42.71 
 
 		 102 aa  87.4  6e-17  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.419495 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1619  hypothetical protein  50 
 
 		 99 aa  86.7  9e-17  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.476859  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4250  hypothetical protein  48.91 
 
 		 94 aa  86.3  1e-16  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.41432  normal  0.497138 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4658  hypothetical protein  47.78 
 
 		 95 aa  83.6  8e-16  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.768607  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1440  hypothetical protein  45.56 
 
 		 95 aa  82  0.000000000000003  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.997199 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7511  hypothetical protein  46.67 
 
 		 95 aa  81.3  0.000000000000004  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.860048 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1420  cupin 2, barrel  44.44 
 
 		 95 aa  78.2  0.00000000000004  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.809174  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3964  cupin 2, barrel  43.18 
 
 		 95 aa  76.3  0.0000000000001  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.0415147  normal  0.762115 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6852  hypothetical protein  44.29 
 
 		 73 aa  61.2  0.000000004  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.657654  normal  0.286237 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3325  mannose-6-phosphate isomerase, type II  31.52 
 
 		 448 aa  40.8  0.006  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.321079 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>