19 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mrad2831_3900 on replicon NC_010505
Organism: Methylobacterium radiotolerans JCM 2831



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010505  Mrad2831_3900  cupin 2 domain-containing protein  100 
 
 		 108 aa  221  2e-57  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.487212 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1491  Cupin 2 conserved barrel domain protein  82.35 
 
 		 102 aa  181  2.0000000000000003e-45  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_0685  cupin 2 domain-containing protein  79.41 
 
 		 102 aa  174  4e-43  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.419495 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1128  hypothetical protein  44.79 
 
 		 98 aa  88.6  2e-17  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4250  hypothetical protein  46.07 
 
 		 94 aa  87  8e-17  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.41432  normal  0.497138 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0207  hypothetical protein  47.19 
 
 		 95 aa  86.7  1e-16  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.731154  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_01610  hypothetical protein  47.19 
 
 		 95 aa  85.9  2e-16  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.522727  normal  0.697897 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2708  cupin 2 protein  45.78 
 
 		 93 aa  82.8  0.000000000000001  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.126395  normal  0.479174 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1420  cupin 2, barrel  43.62 
 
 		 95 aa  81.6  0.000000000000003  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.809174  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0412  hypothetical protein  42.7 
 
 		 94 aa  82  0.000000000000003  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1619  hypothetical protein  43.62 
 
 		 99 aa  79.3  0.00000000000002  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.476859  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4658  hypothetical protein  44.68 
 
 		 95 aa  79  0.00000000000002  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.768607  n/a   
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7511  hypothetical protein  42.05 
 
 		 95 aa  78.6  0.00000000000003  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.860048 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1440  hypothetical protein  41.49 
 
 		 95 aa  74.7  0.0000000000004  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.997199 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3964  cupin 2, barrel  42.53 
 
 		 95 aa  71.2  0.000000000004  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.0415147  normal  0.762115 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0764  hypothetical protein  40.38 
 
 		 76 aa  67  0.00000000009  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6852  hypothetical protein  40 
 
 		 73 aa  53.1  0.000001  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.657654  normal  0.286237 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0389  cupin 2 domain-containing protein  34.38 
 
 		 122 aa  40  0.009  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3496  Cupin 2 conserved barrel domain protein  35.14 
 
 		 140 aa  40  0.01  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>