19 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene RPB_1440 on replicon NC_007778
Organism: Rhodopseudomonas palustris HaA2



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007778  RPB_1440  hypothetical protein  100 
 
 		 95 aa  196  7.999999999999999e-50  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.997199 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1420  cupin 2, barrel  87.23 
 
 		 95 aa  175  2e-43  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.809174  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4658  hypothetical protein  83.16 
 
 		 95 aa  167  3e-41  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.768607  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3964  cupin 2, barrel  74.47 
 
 		 95 aa  151  2.9999999999999998e-36  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.0415147  normal  0.762115 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6852  hypothetical protein  76.39 
 
 		 73 aa  113  7.999999999999999e-25  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.657654  normal  0.286237 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_01610  hypothetical protein  59.3 
 
 		 95 aa  110  9e-24  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.522727  normal  0.697897 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0207  hypothetical protein  58.14 
 
 		 95 aa  106  1e-22  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.731154  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0412  hypothetical protein  53.26 
 
 		 94 aa  100  7e-21  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4250  hypothetical protein  52.33 
 
 		 94 aa  98.6  3e-20  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.41432  normal  0.497138 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1619  hypothetical protein  48.84 
 
 		 99 aa  94  7e-19  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.476859  normal  1 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7511  hypothetical protein  48.81 
 
 		 95 aa  83.6  8e-16  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.860048 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1128  hypothetical protein  45.56 
 
 		 98 aa  82  0.000000000000003  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_0685  cupin 2 domain-containing protein  46.88 
 
 		 102 aa  79.3  0.00000000000002  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.419495 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1491  Cupin 2 conserved barrel domain protein  44.68 
 
 		 102 aa  77  0.00000000000008  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2708  cupin 2 protein  43.33 
 
 		 93 aa  75.9  0.0000000000002  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.126395  normal  0.479174 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3900  cupin 2 domain-containing protein  41.49 
 
 		 108 aa  74.7  0.0000000000004  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.487212 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3881  hypothetical protein  37.5 
 
 		 100 aa  51.6  0.000003  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4272  hypothetical protein  37.5 
 
 		 100 aa  51.2  0.000004  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.0273731  hitchhiker  0.00830783 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3895  hypothetical protein  30.34 
 
 		 113 aa  42  0.003  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.18342 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>