20 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PA14_01610 on replicon NC_008463
Organism: Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008463  PA14_01610  hypothetical protein  100 
 
 		 95 aa  194  3e-49  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.522727  normal  0.697897 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0207  hypothetical protein  95.79 
 
 		 95 aa  190  6e-48  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.731154  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1619  hypothetical protein  73.91 
 
 		 99 aa  136  1e-31  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.476859  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0412  hypothetical protein  70.33 
 
 		 94 aa  131  3e-30  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4250  hypothetical protein  67.39 
 
 		 94 aa  130  6.999999999999999e-30  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.41432  normal  0.497138 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7511  hypothetical protein  69.15 
 
 		 95 aa  128  3e-29  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.860048 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1420  cupin 2, barrel  61.63 
 
 		 95 aa  111  4.0000000000000004e-24  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.809174  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1440  hypothetical protein  59.3 
 
 		 95 aa  110  9e-24  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.997199 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3964  cupin 2, barrel  52.33 
 
 		 95 aa  99.8  1e-20  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.0415147  normal  0.762115 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4658  hypothetical protein  54.65 
 
 		 95 aa  99.4  2e-20  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.768607  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1128  hypothetical protein  51.06 
 
 		 98 aa  96.3  1e-19  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3900  cupin 2 domain-containing protein  47.19 
 
 		 108 aa  85.9  2e-16  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.487212 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0685  cupin 2 domain-containing protein  49.44 
 
 		 102 aa  85.5  2e-16  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.419495 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6852  hypothetical protein  52.78 
 
 		 73 aa  82.4  0.000000000000002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.657654  normal  0.286237 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1491  Cupin 2 conserved barrel domain protein  48.31 
 
 		 102 aa  82.4  0.000000000000002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2708  cupin 2 protein  47.25 
 
 		 93 aa  79.7  0.00000000000001  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.126395  normal  0.479174 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4181  cupin 2, barrel  32.22 
 
 		 151 aa  44.3  0.0006  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4247  cupin 2 domain-containing protein  32.22 
 
 		 151 aa  44.3  0.0006  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.308806 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4403  cupin 2 domain-containing protein  32.22 
 
 		 151 aa  44.3  0.0006  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.707936  normal  0.738548 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4272  hypothetical protein  36.23 
 
 		 100 aa  40.4  0.008  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.0273731  hitchhiker  0.00830783 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>