26 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene RPD_1072 on replicon NC_007958
Organism: Rhodopseudomonas palustris BisB5



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007958  RPD_1072  hypothetical protein  100 
 
 		 300 aa  617  1e-176  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0968  hypothetical protein  90.67 
 
 		 298 aa  558  1e-158  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_5102  hypothetical protein  76.74 
 
 		 300 aa  492  9.999999999999999e-139  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4464  hypothetical protein  70.53 
 
 		 301 aa  399  9.999999999999999e-111  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3634  hypothetical protein  60.9 
 
 		 298 aa  340  1e-92  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.651721 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0409  hypothetical protein  52.49 
 
 		 284 aa  326  3e-88  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.991789  normal  0.340922 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0218  hypothetical protein  58.04 
 
 		 280 aa  321  9.000000000000001e-87  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.776931  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1586  hypothetical protein  51.19 
 
 		 281 aa  270  2e-71  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.689217 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1259  hypothetical protein  52.35 
 
 		 275 aa  270  2e-71  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.495677  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1543  hypothetical protein  52.35 
 
 		 275 aa  270  2e-71  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1457  hypothetical protein  52.05 
 
 		 280 aa  265  5e-70  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00609075 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1416  hypothetical protein  49.82 
 
 		 280 aa  259  5.0000000000000005e-68  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0999  hypothetical protein  45.92 
 
 		 285 aa  241  1e-62  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.0735547  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1571  hypothetical protein  45.17 
 
 		 275 aa  237  1e-61  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5905  hypothetical protein  40.78 
 
 		 288 aa  226  3e-58  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0110  hypothetical protein  44.33 
 
 		 290 aa  218  8.999999999999998e-56  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.907911 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2193  hypothetical protein  44.18 
 
 		 276 aa  202  6e-51  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.0957966  normal  0.567154 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3597  hypothetical protein  43.43 
 
 		 297 aa  201  9e-51  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.281094  normal  0.0338469 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0542  hypothetical protein  43.45 
 
 		 276 aa  191  1e-47  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.218634  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1245  hypothetical protein  44.31 
 
 		 277 aa  181  1e-44  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.806576 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_01370  hypothetical protein  27.76 
 
 		 287 aa  95.5  1e-18  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1418  hypothetical protein  24.41 
 
 		 278 aa  85.1  0.000000000000001  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.318013 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0276  hypothetical protein  27.74 
 
 		 293 aa  70.9  0.00000000003  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.386829  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0632  hypothetical protein  24.6 
 
 		 514 aa  62  0.00000001  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.489107  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0566  hypothetical protein  26.09 
 
 		 552 aa  58.5  0.0000001  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0583  hypothetical protein  25.29 
 
 		 552 aa  58.5  0.0000001  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>