25 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Gdia_1571 on replicon NC_011365
Organism: Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011365  Gdia_1571  hypothetical protein  100 
 
 
275 aa  555  1e-157  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0110  hypothetical protein  61.74 
 
 
290 aa  340  1e-92  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal  0.907911 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5905  hypothetical protein  56.67 
 
 
288 aa  332  4e-90  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3597  hypothetical protein  60.82 
 
 
297 aa  278  9e-74  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.281094  normal  0.0338469 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0999  hypothetical protein  51.34 
 
 
285 aa  256  3e-67  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.0735547  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1416  hypothetical protein  49.07 
 
 
280 aa  241  1e-62  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2193  hypothetical protein  49.81 
 
 
276 aa  240  1e-62  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.0957966  normal  0.567154 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0218  hypothetical protein  48.51 
 
 
280 aa  236  4e-61  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.776931  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0542  hypothetical protein  50 
 
 
276 aa  234  1.0000000000000001e-60  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.218634  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_5102  hypothetical protein  44.79 
 
 
300 aa  232  6e-60  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1245  hypothetical protein  50.68 
 
 
277 aa  226  3e-58  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal  0.806576 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1543  hypothetical protein  45.66 
 
 
275 aa  224  9e-58  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1259  hypothetical protein  45.66 
 
 
275 aa  224  9e-58  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.495677  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0968  hypothetical protein  43.6 
 
 
298 aa  224  1e-57  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4464  hypothetical protein  43.6 
 
 
301 aa  216  4e-55  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1586  hypothetical protein  44.57 
 
 
281 aa  215  5e-55  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal  0.689217 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1072  hypothetical protein  44.48 
 
 
300 aa  214  1.9999999999999998e-54  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0409  hypothetical protein  41.04 
 
 
284 aa  213  1.9999999999999998e-54  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.991789  normal  0.340922 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3634  hypothetical protein  42.56 
 
 
298 aa  213  2.9999999999999995e-54  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.651721 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1457  hypothetical protein  43.82 
 
 
280 aa  209  3e-53  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00609075 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1418  hypothetical protein  29.21 
 
 
278 aa  92  1e-17  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal  0.318013 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_01370  hypothetical protein  27.7 
 
 
287 aa  90.5  3e-17  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0632  hypothetical protein  23.41 
 
 
514 aa  57.4  0.0000002  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.489107  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0276  hypothetical protein  27.48 
 
 
293 aa  57.4  0.0000003  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.386829  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2550  hypothetical protein  21.34 
 
 
302 aa  45.8  0.0008  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0605029  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>