25 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rru_A0999 on replicon NC_007643
Organism: Rhodospirillum rubrum ATCC 11170



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007643  Rru_A0999  hypothetical protein  100 
 
 		 285 aa  573  1.0000000000000001e-162  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.0735547  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_3597  hypothetical protein  55.11 
 
 		 297 aa  263  3e-69  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.281094  normal  0.0338469 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5905  hypothetical protein  45.74 
 
 		 288 aa  258  9e-68  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1571  hypothetical protein  51.34 
 
 		 275 aa  256  3e-67  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0110  hypothetical protein  47.64 
 
 		 290 aa  252  5.000000000000001e-66  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.907911 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_5102  hypothetical protein  47.46 
 
 		 300 aa  242  3.9999999999999997e-63  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0968  hypothetical protein  46.26 
 
 		 298 aa  239  2.9999999999999997e-62  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0218  hypothetical protein  51.17 
 
 		 280 aa  237  2e-61  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.776931  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0409  hypothetical protein  47.74 
 
 		 284 aa  234  1.0000000000000001e-60  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.991789  normal  0.340922 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4464  hypothetical protein  47.21 
 
 		 301 aa  231  7.000000000000001e-60  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1416  hypothetical protein  47.53 
 
 		 280 aa  227  2e-58  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1543  hypothetical protein  46.95 
 
 		 275 aa  220  1.9999999999999999e-56  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1259  hypothetical protein  46.95 
 
 		 275 aa  220  1.9999999999999999e-56  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.495677  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3634  hypothetical protein  44.09 
 
 		 298 aa  219  5e-56  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.651721 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1072  hypothetical protein  45.92 
 
 		 300 aa  216  2e-55  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2193  hypothetical protein  46.52 
 
 		 276 aa  212  5.999999999999999e-54  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.0957966  normal  0.567154 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0542  hypothetical protein  46.38 
 
 		 276 aa  210  2e-53  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.218634  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1586  hypothetical protein  45.35 
 
 		 281 aa  206  3e-52  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.689217 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1245  hypothetical protein  44.61 
 
 		 277 aa  202  4e-51  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.806576 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1457  hypothetical protein  45.11 
 
 		 280 aa  198  9e-50  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00609075 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_01370  hypothetical protein  25.59 
 
 		 287 aa  75.5  0.0000000000008  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1418  hypothetical protein  23.11 
 
 		 278 aa  70.5  0.00000000003  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.318013 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0632  hypothetical protein  23.83 
 
 		 514 aa  65.1  0.000000001  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.489107  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0276  hypothetical protein  26.49 
 
 		 293 aa  50.8  0.00003  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.386829  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0029  hypothetical protein  24.91 
 
 		 377 aa  44.7  0.002  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>