14 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene RPC_3028 on replicon NC_007925
Organism: Rhodopseudomonas palustris BisB18



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007925  RPC_3028  hypothetical protein  100 
 
 		 362 aa  727    Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.239362  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6203  hypothetical protein  54.18 
 
 		 298 aa  277  2e-73  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.333673  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2514  hypothetical protein  47.99 
 
 		 289 aa  255  7e-67  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.439914  normal  0.283811 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2215  hypothetical protein  50.19 
 
 		 290 aa  254  2.0000000000000002e-66  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2461  hypothetical protein  48.46 
 
 		 290 aa  239  5e-62  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.0566155  n/a   
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5213  hypothetical protein  46.46 
 
 		 265 aa  226  7e-58  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.427112  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0083  hypothetical protein  43 
 
 		 296 aa  222  9e-57  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.89818  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7148  hypothetical protein  43.17 
 
 		 296 aa  213  3.9999999999999995e-54  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.480312  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3782  hypothetical protein  49.43 
 
 		 300 aa  209  9e-53  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3625  conserved hypothetical protein; putative exported protein  41.91 
 
 		 295 aa  202  5e-51  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.596583  normal  0.0335901 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3430  hypothetical protein  41.76 
 
 		 295 aa  201  1.9999999999999998e-50  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.349216  normal  0.779975 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3739  hypothetical protein  41.76 
 
 		 294 aa  201  1.9999999999999998e-50  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2276  hypothetical protein  25.56 
 
 		 262 aa  49.3  0.0001  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2019  hypothetical protein  32.89 
 
 		 226 aa  45.4  0.001  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.435594  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>