13 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene BBta_3782 on replicon NC_009485
Organism: Bradyrhizobium sp. BTAi1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009485  BBta_3782  hypothetical protein  100 
 
 		 300 aa  596  1e-169  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6203  hypothetical protein  51.71 
 
 		 298 aa  270  2e-71  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.333673  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3028  hypothetical protein  50.57 
 
 		 362 aa  256  2e-67  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.239362  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2461  hypothetical protein  41.82 
 
 		 290 aa  215  8e-55  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.0566155  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2514  hypothetical protein  43.51 
 
 		 289 aa  208  7e-53  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.439914  normal  0.283811 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2215  hypothetical protein  42.47 
 
 		 290 aa  204  2e-51  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7148  hypothetical protein  43.17 
 
 		 296 aa  203  2e-51  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.480312  n/a   
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5213  hypothetical protein  41.9 
 
 		 265 aa  197  2.0000000000000003e-49  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.427112  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0083  hypothetical protein  40.83 
 
 		 296 aa  182  4.0000000000000006e-45  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.89818  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3430  hypothetical protein  40.68 
 
 		 295 aa  173  2.9999999999999996e-42  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.349216  normal  0.779975 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3739  hypothetical protein  40.68 
 
 		 294 aa  173  2.9999999999999996e-42  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3625  conserved hypothetical protein; putative exported protein  39.33 
 
 		 295 aa  172  6.999999999999999e-42  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.596583  normal  0.0335901 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2276  hypothetical protein  28.25 
 
 		 262 aa  50.8  0.00003  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>