13 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Avi_2461 on replicon NC_011989
Organism: Agrobacterium vitis S4



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011989  Avi_2461  hypothetical protein  100 
 
 		 290 aa  573  1.0000000000000001e-163  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.0566155  n/a   
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5213  hypothetical protein  69.6 
 
 		 265 aa  356  1.9999999999999998e-97  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.427112  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2514  hypothetical protein  56.09 
 
 		 289 aa  308  8e-83  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.439914  normal  0.283811 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2215  hypothetical protein  58.27 
 
 		 290 aa  306  2.0000000000000002e-82  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6203  hypothetical protein  52.69 
 
 		 298 aa  255  5e-67  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.333673  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3028  hypothetical protein  48.46 
 
 		 362 aa  229  4e-59  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.239362  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0083  hypothetical protein  42.11 
 
 		 296 aa  186  4e-46  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.89818  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7148  hypothetical protein  39.18 
 
 		 296 aa  184  1.0000000000000001e-45  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.480312  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3430  hypothetical protein  41.98 
 
 		 295 aa  182  6e-45  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.349216  normal  0.779975 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3739  hypothetical protein  41.98 
 
 		 294 aa  182  6e-45  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3625  conserved hypothetical protein; putative exported protein  40.08 
 
 		 295 aa  177  2e-43  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.596583  normal  0.0335901 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3782  hypothetical protein  40 
 
 		 300 aa  174  1.9999999999999998e-42  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2276  hypothetical protein  27.23 
 
 		 262 aa  65.1  0.000000001  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>