26 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene RPB_1127 on replicon NC_007778
Organism: Rhodopseudomonas palustris HaA2



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007778  RPB_1127  hypothetical protein  100 
 
 		 129 aa  263  5e-70  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.0614776  normal  0.694402 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1242  hypothetical protein  89.92 
 
 		 129 aa  228  2e-59  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4328  hypothetical protein  81.4 
 
 		 125 aa  219  9e-57  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.363199 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1260  hypothetical protein  81.4 
 
 		 125 aa  219  9.999999999999999e-57  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.357949  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_4016  hypothetical protein  78.29 
 
 		 125 aa  211  1.9999999999999998e-54  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2701  hypothetical protein  76.74 
 
 		 163 aa  204  2e-52  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.0364226  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2380  hypothetical protein  86.41 
 
 		 146 aa  196  7e-50  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.37673 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1477  hypothetical protein  54.84 
 
 		 146 aa  139  1.9999999999999998e-32  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0962  hypothetical protein  43.65 
 
 		 123 aa  113  8.999999999999998e-25  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2615  hypothetical protein  47.66 
 
 		 107 aa  111  4.0000000000000004e-24  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.0733143  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1168  hypothetical protein  42.34 
 
 		 140 aa  110  9e-24  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0665  hypothetical protein  44.86 
 
 		 111 aa  106  1e-22  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.347875  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0671  hypothetical protein  44.86 
 
 		 127 aa  105  2e-22  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1016  hypothetical protein  41.61 
 
 		 148 aa  103  7e-22  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.586424 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1064  hypothetical protein  45.36 
 
 		 144 aa  95.1  3e-19  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.589479  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4669  hypothetical protein  42.11 
 
 		 149 aa  93.6  8e-19  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.675478 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4300  hypothetical protein  42.11 
 
 		 151 aa  92.4  2e-18  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3985  hypothetical protein  47.42 
 
 		 162 aa  92  2e-18  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.712541  decreased coverage  0.00103127 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2096  hypothetical protein  44.21 
 
 		 146 aa  92  2e-18  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0697301  normal  0.0426067 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4818  hypothetical protein  43.16 
 
 		 151 aa  92.4  2e-18  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.530671  normal  0.143523 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1090  hypothetical protein  42.22 
 
 		 229 aa  91.7  3e-18  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0709  putative signal peptide protein  44.55 
 
 		 147 aa  86.7  1e-16  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.41606 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0715  hypothetical protein  41.28 
 
 		 214 aa  85.5  2e-16  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.335973 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1465  hypothetical protein  41.35 
 
 		 149 aa  83.2  0.000000000000001  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0757  hypothetical protein  35.96 
 
 		 126 aa  76.3  0.0000000000001  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0823  hypothetical protein  40 
 
 		 162 aa  53.5  0.0000009  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.32462  hitchhiker  0.000215418 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>