19 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mmar10_0823 on replicon NC_008347
Organism: Maricaulis maris MCS10



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008347  Mmar10_0823  hypothetical protein  100 
 
 
162 aa  325  2.0000000000000001e-88  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.32462  hitchhiker  0.000215418 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1260  hypothetical protein  42.11 
 
 
125 aa  57.8  0.00000006  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.357949  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4328  hypothetical protein  40.82 
 
 
125 aa  55.8  0.0000002  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal  0.363199 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2380  hypothetical protein  42.42 
 
 
146 aa  53.9  0.0000008  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.37673 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4418  hypothetical protein  40 
 
 
146 aa  54.3  0.0000008  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1127  hypothetical protein  40 
 
 
129 aa  53.5  0.000001  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.0614776  normal  0.694402 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_4016  hypothetical protein  38 
 
 
125 aa  53.5  0.000001  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1242  hypothetical protein  39.8 
 
 
129 aa  53.1  0.000002  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1168  hypothetical protein  36.51 
 
 
140 aa  51.2  0.000005  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1016  hypothetical protein  36.99 
 
 
148 aa  50.8  0.000007  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.586424 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2701  hypothetical protein  38.89 
 
 
163 aa  50.4  0.00001  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.0364226  normal 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2615  hypothetical protein  37.08 
 
 
107 aa  46.6  0.0001  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.0733143  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0709  putative signal peptide protein  38.1 
 
 
147 aa  46.6  0.0001  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.41606 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0962  hypothetical protein  42.86 
 
 
123 aa  45.1  0.0004  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0665  hypothetical protein  34.83 
 
 
111 aa  44.3  0.0007  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.347875  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1477  hypothetical protein  32.58 
 
 
146 aa  44.3  0.0008  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004310  BR0671  hypothetical protein  34.83 
 
 
127 aa  43.9  0.001  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1465  hypothetical protein  33.33 
 
 
149 aa  42.4  0.003  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0757  hypothetical protein  35.38 
 
 
126 aa  41.2  0.007  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>