26 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mnod_1064 on replicon NC_011894
Organism: Methylobacterium nodulans ORS 2060



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011894  Mnod_1064  hypothetical protein  100 
 
 
144 aa  282  1.0000000000000001e-75  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.589479  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_2096  hypothetical protein  89.69 
 
 
146 aa  181  3e-45  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0697301  normal  0.0426067 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3985  hypothetical protein  66.42 
 
 
162 aa  162  1.0000000000000001e-39  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.712541  decreased coverage  0.00103127 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4818  hypothetical protein  65.83 
 
 
151 aa  155  2e-37  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.530671  normal  0.143523 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4669  hypothetical protein  61.54 
 
 
149 aa  152  1e-36  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal  0.675478 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4300  hypothetical protein  72.16 
 
 
151 aa  150  4e-36  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0715  hypothetical protein  48.21 
 
 
214 aa  107  4.0000000000000004e-23  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal  0.335973 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1260  hypothetical protein  46.67 
 
 
125 aa  100  6e-21  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.357949  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1242  hypothetical protein  47 
 
 
129 aa  98.2  3e-20  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1477  hypothetical protein  44.12 
 
 
146 aa  98.2  3e-20  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_4016  hypothetical protein  44.86 
 
 
125 aa  97.8  4e-20  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4328  hypothetical protein  44.76 
 
 
125 aa  97.1  7e-20  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal  0.363199 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2380  hypothetical protein  45 
 
 
146 aa  96.7  8e-20  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.37673 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1127  hypothetical protein  37.86 
 
 
129 aa  96.7  1e-19  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.0614776  normal  0.694402 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0962  hypothetical protein  44.76 
 
 
123 aa  94.4  5e-19  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1016  hypothetical protein  40.97 
 
 
148 aa  94  6e-19  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.586424 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1168  hypothetical protein  38.73 
 
 
140 aa  93.2  1e-18  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2615  hypothetical protein  46.46 
 
 
107 aa  92  2e-18  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.0733143  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2701  hypothetical protein  41.12 
 
 
163 aa  89.7  1e-17  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.0364226  normal 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1090  hypothetical protein  43.96 
 
 
229 aa  87  8e-17  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1465  hypothetical protein  42.99 
 
 
149 aa  84.7  3e-16  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0709  putative signal peptide protein  41.58 
 
 
147 aa  84.3  4e-16  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.41606 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0665  hypothetical protein  40.74 
 
 
111 aa  82.4  0.000000000000002  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.347875  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0671  hypothetical protein  40.74 
 
 
127 aa  82.4  0.000000000000002  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0757  hypothetical protein  31.18 
 
 
126 aa  55.8  0.0000002  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0823  hypothetical protein  34.96 
 
 
162 aa  41.2  0.005  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.32462  hitchhiker  0.000215418 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>