25 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mrad2831_3985 on replicon NC_010505
Organism: Methylobacterium radiotolerans JCM 2831



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010505  Mrad2831_3985  hypothetical protein  100 
 
 
162 aa  314  3e-85  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.712541  decreased coverage  0.00103127 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4818  hypothetical protein  68.84 
 
 
151 aa  182  2.0000000000000003e-45  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.530671  normal  0.143523 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4669  hypothetical protein  65.99 
 
 
149 aa  181  5.0000000000000004e-45  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal  0.675478 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4300  hypothetical protein  82.47 
 
 
151 aa  176  1e-43  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1064  hypothetical protein  75.24 
 
 
144 aa  171  3.9999999999999995e-42  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.589479  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_2096  hypothetical protein  76.29 
 
 
146 aa  164  5e-40  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0697301  normal  0.0426067 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0715  hypothetical protein  43.8 
 
 
214 aa  112  2.0000000000000002e-24  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal  0.335973 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1260  hypothetical protein  49 
 
 
125 aa  105  4e-22  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.357949  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_4016  hypothetical protein  48.45 
 
 
125 aa  103  9e-22  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4328  hypothetical protein  47 
 
 
125 aa  103  1e-21  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal  0.363199 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1127  hypothetical protein  47.42 
 
 
129 aa  102  2e-21  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.0614776  normal  0.694402 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1242  hypothetical protein  48 
 
 
129 aa  102  2e-21  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1477  hypothetical protein  48.51 
 
 
146 aa  101  4e-21  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2380  hypothetical protein  46 
 
 
146 aa  101  5e-21  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.37673 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1168  hypothetical protein  40.32 
 
 
140 aa  100  1e-20  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2701  hypothetical protein  47 
 
 
163 aa  99  2e-20  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.0364226  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1016  hypothetical protein  40.32 
 
 
148 aa  95.1  4e-19  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.586424 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0709  putative signal peptide protein  43.56 
 
 
147 aa  89.7  2e-17  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.41606 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1465  hypothetical protein  43.12 
 
 
149 aa  89  2e-17  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0962  hypothetical protein  38.74 
 
 
123 aa  88.6  3e-17  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2615  hypothetical protein  41.41 
 
 
107 aa  87.4  6e-17  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.0733143  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1090  hypothetical protein  40.66 
 
 
229 aa  86.3  2e-16  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0665  hypothetical protein  40.4 
 
 
111 aa  82  0.000000000000003  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.347875  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0671  hypothetical protein  40.4 
 
 
127 aa  82  0.000000000000003  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0757  hypothetical protein  27.27 
 
 
126 aa  50.4  0.000009  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>