17 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Psyc_1966 on replicon NC_007204
Organism: Psychrobacter arcticus 273-4



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007204  Psyc_1966  hypothetical protein  100 
 
 		 239 aa  496  1e-139  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.73839  hitchhiker  0.000135585 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_2262  hypothetical protein  86.19 
 
 		 239 aa  437  9.999999999999999e-123  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.051771  hitchhiker  0.00807275 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_2258  G:T/U mismatch-specific DNA glycosylase-like protein  67.79 
 
 		 211 aa  293  2e-78  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000630044  normal  1 
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0946  hypothetical protein  29.41 
 
 		 171 aa  53.5  0.000003  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_1270  hypothetical protein  28.57 
 
 		 160 aa  52.8  0.000004  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  0.0254283  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE1391  hypothetical protein  27.07 
 
 		 160 aa  52  0.000008  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0471  hypothetical protein  25.76 
 
 		 160 aa  51.2  0.00001  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  0.0142072  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1935  Mug G:T/U mismatch-specific DNA glycosylase  24.82 
 
 		 168 aa  50.1  0.00003  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  0.346025  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1099  G:T/U mismatch-specific DNA glycosylase  25.58 
 
 		 173 aa  49.7  0.00004  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.792997  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1263  Mug G:T/U mismatch-specific DNA glycosylase  22.52 
 
 		 157 aa  47.8  0.0001  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2134  hypothetical protein  30.15 
 
 		 173 aa  48.1  0.0001  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  unclonable  0.00000000535646  normal  0.960143 
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0526  G:T/U mismatch-specific DNA glycosylase  28.19 
 
 		 194 aa  47.4  0.0002  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0082  hypothetical protein  26.36 
 
 		 157 aa  47  0.0003  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0444  Uracil-DNA glycosylase superfamily  25.4 
 
 		 185 aa  44.7  0.001  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_14820  yjeF-like protein  25.58 
 
 		 447 aa  42.7  0.005  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  0.0790751 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3959  uracil-DNA glycosylase superfamily protein  23.19 
 
 		 190 aa  42.4  0.007  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.306587 
 
 
-
 
NC_002967  TDE1611  hypothetical protein  21.71 
 
 		 217 aa  42  0.009  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>