76 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Psyc_1262 on replicon NC_007204
Organism: Psychrobacter arcticus 273-4



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007204  Psyc_1262  hypothetical protein  100 
 
 		 130 aa  270  4.0000000000000004e-72  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.533779  normal  1 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1123  hypothetical protein  85.71 
 
 		 119 aa  212  9.999999999999999e-55  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.44189  normal  0.554686 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1576  hypothetical protein  69.15 
 
 		 113 aa  142  2e-33  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  0.673806  hitchhiker  0.006238 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1550  hypothetical protein  35.23 
 
 		 98 aa  56.2  0.0000001  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1968  protein of unknown function DUF493  30.95 
 
 		 89 aa  54.3  0.0000005  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_08440  hypothetical protein  31.52 
 
 		 92 aa  53.9  0.0000006  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.127353  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3280  hypothetical protein  34.07 
 
 		 88 aa  53.9  0.0000007  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.00000870695  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3322  hypothetical protein  34.07 
 
 		 88 aa  53.9  0.0000007  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.000559481  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3458  hypothetical protein  34.07 
 
 		 88 aa  53.9  0.0000007  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.00375963  normal  0.0238202 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1087  hypothetical protein  34.07 
 
 		 88 aa  53.9  0.0000007  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.00000786654  hitchhiker  0.0000064685 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0412  hypothetical protein  27.38 
 
 		 105 aa  52.8  0.000002  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2874  hypothetical protein  33.33 
 
 		 88 aa  51.6  0.000003  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.00000389579  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01651  hypothetical protein  35.16 
 
 		 87 aa  52  0.000003  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  hitchhiker  0.0000575262  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0472  hypothetical protein  24.3 
 
 		 127 aa  50.4  0.000009  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.439852  normal  0.58229 
 
 
-
 
NC_004347  SO_1163  hypothetical protein  32.56 
 
 		 88 aa  49.7  0.00001  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_12110  hypothetical protein  32.97 
 
 		 93 aa  49.7  0.00001  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2499  hypothetical protein  25 
 
 		 97 aa  49.3  0.00002  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0986  hypothetical protein  31.4 
 
 		 88 aa  48.9  0.00002  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.000000105204  normal  0.0165558 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1051  hypothetical protein  31.4 
 
 		 88 aa  48.9  0.00002  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  hitchhiker  0.0000671726  hitchhiker  0.00478592 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0990  hypothetical protein  31.4 
 
 		 88 aa  48.9  0.00002  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.000075069  normal  0.687839 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1111  hypothetical protein  32.97 
 
 		 93 aa  48.9  0.00003  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3793  hypothetical protein  30.43 
 
 		 92 aa  48.5  0.00003  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3713  hypothetical protein  31.11 
 
 		 88 aa  46.2  0.0001  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  decreased coverage  0.0000213543  hitchhiker  0.00129495 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2940  hypothetical protein  31.87 
 
 		 88 aa  47  0.0001  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  hitchhiker  0.000039404  normal  0.0192635 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0289  hypothetical protein  28.57 
 
 		 89 aa  47  0.0001  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.68869 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0281  hypothetical protein  28.28 
 
 		 101 aa  46.6  0.0001  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004226  UPF0250 protein  33.33 
 
 		 92 aa  45.8  0.0002  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  unclonable  0.00000000561053  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1197  hypothetical protein  32.56 
 
 		 87 aa  45.4  0.0002  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01213  hypothetical protein  33.33 
 
 		 92 aa  45.8  0.0002  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0224  hypothetical protein  25.29 
 
 		 102 aa  45.8  0.0002  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006369  lpl1515  hypothetical protein  30.95 
 
 		 87 aa  46.2  0.0002  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1468  hypothetical protein  30.95 
 
 		 87 aa  46.2  0.0002  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3936  hypothetical protein  29.55 
 
 		 89 aa  45.8  0.0002  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.224066  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0469  hypothetical protein  30.43 
 
 		 92 aa  45.1  0.0003  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.00000000304752  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc0326  hypothetical protein  28.24 
 
 		 97 aa  44.7  0.0004  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1088  hypothetical protein  47.62 
 
 		 87 aa  44.7  0.0004  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.0973473  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0245  hypothetical protein  27.59 
 
 		 103 aa  44.3  0.0005  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1555  hypothetical protein  32.58 
 
 		 87 aa  44.7  0.0005  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  hitchhiker  0.0000623107  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3490  hypothetical protein  32.22 
 
 		 88 aa  44.3  0.0005  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000408093 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1166  hypothetical protein  32.56 
 
 		 87 aa  44.3  0.0006  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.332478  normal  0.283703 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4879  protein of unknown function DUF493  24.44 
 
 		 104 aa  44.3  0.0006  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3154  hypothetical protein  31.11 
 
 		 88 aa  43.9  0.0008  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  hitchhiker  0.000000128266  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1711  hypothetical protein  26.32 
 
 		 87 aa  43.1  0.001  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.654442  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0500  protein of unknown function DUF493  26.67 
 
 		 89 aa  43.1  0.001  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.0729827 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0364  hypothetical protein  24 
 
 		 103 aa  43.1  0.001  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  0.395304 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0295  protein of unknown function DUF493  22.22 
 
 		 98 aa  42.4  0.002  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.883661  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2995  protein of unknown function DUF493  31.4 
 
 		 87 aa  42.4  0.002  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.000000919555  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00589  hypothetical protein  31.4 
 
 		 87 aa  42.4  0.002  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.067474  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0719  hypothetical protein  31.4 
 
 		 87 aa  42.4  0.002  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  unclonable  0.00000000310353  normal  0.764617 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0738  hypothetical protein  32.56 
 
 		 87 aa  42.7  0.002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  hitchhiker  0.00130336  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0678  hypothetical protein  32.56 
 
 		 87 aa  42.7  0.002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.00000000567812  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2968  hypothetical protein  45.24 
 
 		 87 aa  42.4  0.002  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.0220242  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0796  hypothetical protein  32.56 
 
 		 87 aa  42.7  0.002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  hitchhiker  0.00125939  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0752  hypothetical protein  32.56 
 
 		 87 aa  42.7  0.002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.0969467  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0692  hypothetical protein  32.56 
 
 		 87 aa  42.7  0.002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.0108716  normal  1 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0620  hypothetical protein  31.4 
 
 		 87 aa  42.4  0.002  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2593  hypothetical protein  29.07 
 
 		 88 aa  42.4  0.002  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  hitchhiker  0.00140819  normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1989  hypothetical protein  25.51 
 
 		 109 aa  42.7  0.002  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0651  hypothetical protein  31.4 
 
 		 87 aa  42.4  0.002  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  decreased coverage  0.000000004684  normal  1 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3014  hypothetical protein  31.4 
 
 		 87 aa  42.4  0.002  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  hitchhiker  0.00679596  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3025  hypothetical protein  30.59 
 
 		 87 aa  42.7  0.002  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  hitchhiker  0.00091395  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1853  hypothetical protein  30.59 
 
 		 87 aa  42.7  0.002  Yersinia pestis Angola  Bacteria  decreased coverage  0.00000034763  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3336  hypothetical protein  28.09 
 
 		 90 aa  42.4  0.002  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  hitchhiker  0.000115113  normal  0.014798 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2953  hypothetical protein  30.59 
 
 		 87 aa  42.7  0.002  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000897518  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0656  hypothetical protein  31.4 
 
 		 87 aa  42.4  0.002  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.000000367197  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_00600  hypothetical protein  31.4 
 
 		 87 aa  42.4  0.002  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.0652819  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0683  hypothetical protein  31.4 
 
 		 87 aa  42.4  0.002  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  7.58222e-17  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0300  hypothetical protein  22.22 
 
 		 98 aa  41.6  0.003  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00414202 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1265  protein of unknown function DUF493  18.27 
 
 		 112 aa  41.6  0.003  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.0383916  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0188  hypothetical protein  23.81 
 
 		 99 aa  41.6  0.003  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.0239865  normal  0.49594 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1177  hypothetical protein  42.86 
 
 		 87 aa  41.6  0.004  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  unclonable  0.0000450853  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3154  hypothetical protein  42.86 
 
 		 87 aa  41.6  0.004  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  hitchhiker  0.0000847939  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0316  hypothetical protein  25.88 
 
 		 107 aa  41.2  0.005  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.802626  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0243  protein of unknown function DUF493  22.09 
 
 		 94 aa  40.8  0.007  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0182  hypothetical protein  23.81 
 
 		 99 aa  40.4  0.008  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0213  hypothetical protein  26.97 
 
 		 89 aa  40.4  0.009  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>