121 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene TK90_1968 on replicon NC_013889
Organism: Thioalkalivibrio sp. K90mix



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013889  TK90_1968  protein of unknown function DUF493  100 
 
 		 89 aa  183  6e-46  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2276  hypothetical protein  51.76 
 
 		 102 aa  94.4  4e-19  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2891  hypothetical protein  51.76 
 
 		 102 aa  94.4  4e-19  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.436457  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2901  hypothetical protein  51.76 
 
 		 102 aa  94.4  4e-19  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.968413  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6234  hypothetical protein  51.76 
 
 		 102 aa  94.4  5e-19  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.276957 
 
 
-
 
NC_006348  BMA0056  hypothetical protein  50.59 
 
 		 102 aa  92  2e-18  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0622  hypothetical protein  50.59 
 
 		 102 aa  92  2e-18  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.534048  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2941  hypothetical protein  50.59 
 
 		 102 aa  92.8  2e-18  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0222  hypothetical protein  50.59 
 
 		 102 aa  92  2e-18  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1371  hypothetical protein  50.59 
 
 		 102 aa  92  2e-18  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0440  hypothetical protein  50.59 
 
 		 102 aa  92  2e-18  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0460  hypothetical protein  50.59 
 
 		 102 aa  92  2e-18  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.824675  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_3190  hypothetical protein  50.59 
 
 		 102 aa  92  2e-18  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0413  hypothetical protein  49.41 
 
 		 102 aa  92.4  2e-18  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.327313  normal  0.0225093 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2803  hypothetical protein  50.59 
 
 		 102 aa  92.8  2e-18  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0382  hypothetical protein  50.59 
 
 		 102 aa  91.7  3e-18  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2705  hypothetical protein  51.19 
 
 		 87 aa  91.3  4e-18  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2499  hypothetical protein  43.68 
 
 		 97 aa  89.4  2e-17  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0500  protein of unknown function DUF493  47.19 
 
 		 89 aa  89.4  2e-17  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.0729827 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1963  hypothetical protein  47.19 
 
 		 88 aa  84  6e-16  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0472  hypothetical protein  51.69 
 
 		 127 aa  82  0.000000000000002  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.439852  normal  0.58229 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1670  protein of unknown function DUF493  45.35 
 
 		 88 aa  82  0.000000000000002  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0295  protein of unknown function DUF493  48.24 
 
 		 98 aa  80.9  0.000000000000005  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.883661  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1265  protein of unknown function DUF493  45.35 
 
 		 112 aa  80.5  0.000000000000008  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.0383916  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA0107  hypothetical protein  42.86 
 
 		 87 aa  79.7  0.00000000000001  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3936  hypothetical protein  46.43 
 
 		 89 aa  78.6  0.00000000000003  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.224066  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0316  hypothetical protein  44.71 
 
 		 107 aa  78.2  0.00000000000003  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.802626  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0300  hypothetical protein  47.06 
 
 		 98 aa  78.6  0.00000000000003  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00414202 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4879  protein of unknown function DUF493  45.88 
 
 		 104 aa  78.2  0.00000000000003  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0245  hypothetical protein  44.71 
 
 		 103 aa  77.4  0.00000000000006  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0289  hypothetical protein  40.45 
 
 		 89 aa  76.6  0.0000000000001  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.68869 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0364  hypothetical protein  45.88 
 
 		 103 aa  76.6  0.0000000000001  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  0.395304 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0213  hypothetical protein  41.57 
 
 		 89 aa  75.5  0.0000000000002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0412  hypothetical protein  42.35 
 
 		 105 aa  75.1  0.0000000000003  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0326  hypothetical protein  43.18 
 
 		 97 aa  73.9  0.0000000000007  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0178  hypothetical protein  42.53 
 
 		 92 aa  73.6  0.0000000000008  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0243  protein of unknown function DUF493  44.71 
 
 		 94 aa  73.2  0.000000000001  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0281  hypothetical protein  44.05 
 
 		 101 aa  72.8  0.000000000002  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_4239  hypothetical protein  45.24 
 
 		 91 aa  72.4  0.000000000002  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0188  hypothetical protein  41.67 
 
 		 99 aa  72  0.000000000003  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.0239865  normal  0.49594 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0182  hypothetical protein  40.48 
 
 		 99 aa  69.7  0.00000000001  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006368  lpp1468  hypothetical protein  35.29 
 
 		 87 aa  68.9  0.00000000002  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1515  hypothetical protein  35.29 
 
 		 87 aa  68.9  0.00000000002  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1197  hypothetical protein  41.57 
 
 		 87 aa  68.9  0.00000000002  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004226  UPF0250 protein  42.68 
 
 		 92 aa  68.6  0.00000000003  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  unclonable  0.00000000561053  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01213  hypothetical protein  42.68 
 
 		 92 aa  68.6  0.00000000003  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2953  hypothetical protein  38.2 
 
 		 87 aa  67.4  0.00000000006  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000897518  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1853  hypothetical protein  38.2 
 
 		 87 aa  67.4  0.00000000006  Yersinia pestis Angola  Bacteria  decreased coverage  0.00000034763  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3025  hypothetical protein  38.2 
 
 		 87 aa  67.4  0.00000000006  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  hitchhiker  0.00091395  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0224  hypothetical protein  39.29 
 
 		 102 aa  67.4  0.00000000007  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_1163  hypothetical protein  40.48 
 
 		 88 aa  66.2  0.0000000001  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1550  hypothetical protein  37.04 
 
 		 98 aa  66.2  0.0000000001  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1166  hypothetical protein  39.33 
 
 		 87 aa  66.6  0.0000000001  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.332478  normal  0.283703 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0469  hypothetical protein  41.46 
 
 		 92 aa  66.2  0.0000000001  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.00000000304752  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_00600  hypothetical protein  39.33 
 
 		 87 aa  65.9  0.0000000002  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.0652819  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2995  protein of unknown function DUF493  39.33 
 
 		 87 aa  65.9  0.0000000002  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.000000919555  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0268  hypothetical protein  37.21 
 
 		 88 aa  65.9  0.0000000002  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0719  hypothetical protein  39.33 
 
 		 87 aa  65.9  0.0000000002  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  unclonable  0.00000000310353  normal  0.764617 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2874  hypothetical protein  40.48 
 
 		 88 aa  65.5  0.0000000002  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.00000389579  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00589  hypothetical protein  39.33 
 
 		 87 aa  65.9  0.0000000002  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.067474  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0683  hypothetical protein  39.33 
 
 		 87 aa  65.9  0.0000000002  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  7.58222e-17  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0656  hypothetical protein  39.33 
 
 		 87 aa  65.9  0.0000000002  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.000000367197  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3014  hypothetical protein  39.33 
 
 		 87 aa  65.9  0.0000000002  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  hitchhiker  0.00679596  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0651  hypothetical protein  39.33 
 
 		 87 aa  65.9  0.0000000002  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  decreased coverage  0.000000004684  normal  1 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0620  hypothetical protein  39.33 
 
 		 87 aa  65.9  0.0000000002  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2409  hypothetical protein  38.2 
 
 		 89 aa  64.7  0.0000000004  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1177  hypothetical protein  42.7 
 
 		 87 aa  64.3  0.0000000005  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  unclonable  0.0000450853  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0986  hypothetical protein  38.2 
 
 		 88 aa  64.3  0.0000000005  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.000000105204  normal  0.0165558 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1051  hypothetical protein  38.2 
 
 		 88 aa  64.3  0.0000000005  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  hitchhiker  0.0000671726  hitchhiker  0.00478592 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0990  hypothetical protein  38.2 
 
 		 88 aa  64.3  0.0000000005  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.000075069  normal  0.687839 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0692  hypothetical protein  38.2 
 
 		 87 aa  64.3  0.0000000005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.0108716  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0752  hypothetical protein  38.2 
 
 		 87 aa  64.3  0.0000000005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.0969467  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0796  hypothetical protein  38.2 
 
 		 87 aa  64.3  0.0000000005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  hitchhiker  0.00125939  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3154  hypothetical protein  42.7 
 
 		 87 aa  64.3  0.0000000005  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  hitchhiker  0.0000847939  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0678  hypothetical protein  38.2 
 
 		 87 aa  64.3  0.0000000005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.00000000567812  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0738  hypothetical protein  38.2 
 
 		 87 aa  64.3  0.0000000005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  hitchhiker  0.00130336  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_08440  hypothetical protein  38.2 
 
 		 92 aa  63.5  0.0000000009  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.127353  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1637  hypothetical protein  36.36 
 
 		 94 aa  62.4  0.000000002  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  hitchhiker  0.00057154  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4216  hypothetical protein  42.86 
 
 		 70 aa  62.4  0.000000002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3713  hypothetical protein  40.48 
 
 		 88 aa  62.8  0.000000002  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  decreased coverage  0.0000213543  hitchhiker  0.00129495 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1087  hypothetical protein  38.1 
 
 		 88 aa  60.8  0.000000005  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.00000786654  hitchhiker  0.0000064685 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3280  hypothetical protein  38.1 
 
 		 88 aa  60.8  0.000000005  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.00000870695  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3322  hypothetical protein  38.1 
 
 		 88 aa  60.8  0.000000005  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.000559481  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3458  hypothetical protein  38.1 
 
 		 88 aa  60.8  0.000000005  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.00375963  normal  0.0238202 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1088  hypothetical protein  40.45 
 
 		 87 aa  60.8  0.000000006  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.0973473  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2593  hypothetical protein  37.04 
 
 		 88 aa  60.5  0.000000008  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  hitchhiker  0.00140819  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_12110  hypothetical protein  40.24 
 
 		 93 aa  59.7  0.00000001  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1111  hypothetical protein  40.24 
 
 		 93 aa  60.1  0.00000001  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3336  hypothetical protein  35.56 
 
 		 90 aa  58.9  0.00000002  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  hitchhiker  0.000115113  normal  0.014798 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2968  hypothetical protein  40.45 
 
 		 87 aa  59.3  0.00000002  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.0220242  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3028  hypothetical protein  33.33 
 
 		 89 aa  58.9  0.00000002  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.991113  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3490  hypothetical protein  38.1 
 
 		 88 aa  58.9  0.00000002  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000408093 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0981  hypothetical protein  35.37 
 
 		 89 aa  58.2  0.00000004  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.35106  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3793  hypothetical protein  35.96 
 
 		 92 aa  57  0.00000008  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2940  hypothetical protein  39.02 
 
 		 88 aa  56.6  0.0000001  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  hitchhiker  0.000039404  normal  0.0192635 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1989  hypothetical protein  34.34 
 
 		 109 aa  55.5  0.0000002  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4820  hypothetical protein  35.96 
 
 		 91 aa  55.1  0.0000003  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1262  hypothetical protein  30.95 
 
 		 130 aa  54.3  0.0000005  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.533779  normal  1 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1123  hypothetical protein  30.95 
 
 		 119 aa  53.9  0.0000008  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.44189  normal  0.554686 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4360  hypothetical protein  34.83 
 
 		 91 aa  53.1  0.000001  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0734729  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>