16 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pput_4027 on replicon NC_009512
Organism: Pseudomonas putida F1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009512  Pput_4027  Sel1 domain-containing protein  100 
 
 		 139 aa  279  7.000000000000001e-75  Pseudomonas putida F1  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000522378  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1692  Sel1 domain protein repeat-containing protein  99.28 
 
 		 141 aa  277  3e-74  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  hitchhiker  0.000440954  normal  0.56597 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1290  Sel1 domain-containing protein  97.81 
 
 		 139 aa  243  6.999999999999999e-64  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000000341988  normal  0.607736 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1248  hypothetical protein  90 
 
 		 96 aa  165  2e-40  Pseudomonas putida W619  Bacteria  hitchhiker  0.00000895679  normal  0.131526 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1658  hypothetical protein  69.81 
 
 		 107 aa  140  6e-33  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  unclonable  0.00000000000000957137  decreased coverage  0.00112349 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3333  Sel1 domain-containing protein  67.68 
 
 		 103 aa  132  1.9999999999999998e-30  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  hitchhiker  0.00000000200888  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_35250  hypothetical protein  65.45 
 
 		 117 aa  127  4.0000000000000003e-29  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  hitchhiker  0.0000000141879  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1207  Sel1 domain-containing protein  29.13 
 
 		 350 aa  45.1  0.0004  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.838617  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0781  Sel1 domain-containing protein  34.69 
 
 		 393 aa  44.7  0.0005  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.0000000364549  n/a   
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0764  hypothetical protein  31.4 
 
 		 850 aa  42  0.003  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0432  hypothetical protein  32.29 
 
 		 1002 aa  40.8  0.006  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.0267452 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1107  Sel1 domain protein repeat-containing protein  35 
 
 		 270 aa  40.8  0.006  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.00367364  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_04070  TPR repeat-containing protein  29.47 
 
 		 1032 aa  40  0.009  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  0.350939 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1512  Sel1 domain protein repeat-containing protein  32.5 
 
 		 890 aa  40.4  0.009  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.522788  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2894  hypothetical protein  31.4 
 
 		 245 aa  40  0.01  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_1126  Sel1 domain protein repeat-containing protein  31.33 
 
 		 343 aa  40  0.01  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>