54 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Avin_35250 on replicon NC_012560
Organism: Azotobacter vinelandii DJ



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_012560  Avin_35250  hypothetical protein  100 
 
 
117 aa  229  1e-59  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  hitchhiker  0.0000000141879  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_1692  Sel1 domain protein repeat-containing protein  65.45 
 
 
141 aa  127  4.0000000000000003e-29  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  hitchhiker  0.000440954  normal  0.56597 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1290  Sel1 domain-containing protein  65.45 
 
 
139 aa  127  4.0000000000000003e-29  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000000341988  normal  0.607736 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4027  Sel1 domain-containing protein  65.45 
 
 
139 aa  127  5.0000000000000004e-29  Pseudomonas putida F1  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000522378  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3333  Sel1 domain-containing protein  74.36 
 
 
103 aa  112  2.0000000000000002e-24  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  hitchhiker  0.00000000200888  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1658  hypothetical protein  68.83 
 
 
107 aa  103  5e-22  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  unclonable  0.00000000000000957137  decreased coverage  0.00112349 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1248  hypothetical protein  61.11 
 
 
96 aa  103  6e-22  Pseudomonas putida W619  Bacteria  hitchhiker  0.00000895679  normal  0.131526 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2045  Sel1 domain protein repeat-containing protein  31.37 
 
 
865 aa  51.6  0.000004  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002967  TDE1171  hypothetical protein  34.07 
 
 
267 aa  50.4  0.000007  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.786913  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_1123  Sel1 domain protein repeat-containing protein  30.85 
 
 
222 aa  50.1  0.000009  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1174  hypothetical protein  38.3 
 
 
490 aa  49.7  0.00001  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1180  hypothetical protein  38.3 
 
 
490 aa  49.7  0.00002  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0764  hypothetical protein  34.48 
 
 
850 aa  47.8  0.00005  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2705  Sel1 repeat-containing protein  32.61 
 
 
241 aa  47.8  0.00005  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_1811  hypothetical protein  32.97 
 
 
208 aa  47.8  0.00005  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_1126  Sel1 domain protein repeat-containing protein  31.4 
 
 
343 aa  47  0.00009  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2289  Sel1 repeat-containing protein  31.82 
 
 
221 aa  46.6  0.0001  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2699  Sel1 domain-containing protein repeat-containing protein  39.34 
 
 
202 aa  45.8  0.0002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.0148338  normal 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0449  Sel1 domain-containing protein  35.71 
 
 
276 aa  45.4  0.0002  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2885  Sel1 domain protein repeat-containing protein  38.64 
 
 
593 aa  45.1  0.0003  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal  0.048224 
 
 
-
 
NC_008309  HS_0313  TPR repeat-containing protein  32.98 
 
 
252 aa  45.1  0.0004  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.526725  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2820  Sel1 domain protein repeat-containing protein  35 
 
 
157 aa  44.7  0.0004  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3510  Sel1 domain-containing protein  35 
 
 
512 aa  45.1  0.0004  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.765295  normal 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3372  Sel1 domain-containing protein  32.61 
 
 
685 aa  44.3  0.0005  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.0437762  normal  0.412593 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3240  Sel1 domain protein repeat-containing protein  43.33 
 
 
450 aa  44.7  0.0005  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3685  Sel1 domain-containing protein  33.75 
 
 
512 aa  44.3  0.0006  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0781  Sel1 domain-containing protein  32.04 
 
 
393 aa  44.3  0.0006  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.0000000364549  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4839  Sel1 domain-containing protein  36.36 
 
 
181 aa  43.9  0.0007  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0727  hypothetical protein  37.65 
 
 
1366 aa  43.9  0.0008  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.989916 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0635  Sel1 domain-containing protein  36.36 
 
 
181 aa  43.5  0.0009  Pseudomonas putida W619  Bacteria  hitchhiker  0.00101027  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1079  Sel1 domain protein repeat-containing protein  35.96 
 
 
328 aa  43.1  0.001  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.909914  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3674  enhanced entry protein  36.14 
 
 
540 aa  43.1  0.001  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.203101  n/a   
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0852  hypothetical protein  32.26 
 
 
789 aa  43.1  0.001  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00159871 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1085  Sel1 domain protein repeat-containing protein  43.33 
 
 
450 aa  43.5  0.001  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02823  hypothetical protein  32.38 
 
 
256 aa  43.1  0.001  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1457  Sel1  31.33 
 
 
218 aa  43.5  0.001  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0442  Sel1 domain-containing protein  33.75 
 
 
512 aa  43.5  0.001  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.375518  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4785  Sel1 domain protein repeat-containing protein  36.36 
 
 
181 aa  42.7  0.002  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal  0.0833699 
 
 
-
 
NC_006369  lpl1059  hypothetical protein  36.67 
 
 
342 aa  42.4  0.002  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1490  TPR repeat-containing protein  29.09 
 
 
303 aa  42.4  0.002  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  unclonable  5.471259999999999e-20  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_3044  Sel1-like protein  32.69 
 
 
169 aa  42.7  0.002  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4661  Sel1 domain-containing protein  36.36 
 
 
181 aa  42.7  0.002  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.150722  normal  0.332421 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0697  sel1 repeat-containing family protein  28.57 
 
 
331 aa  42  0.003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.10663  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2686  hypothetical protein  32.26 
 
 
961 aa  42  0.003  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  hitchhiker  0.00825713  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3776  Sel1 domain-containing protein  35.21 
 
 
182 aa  42  0.003  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal  0.17848 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0104  Sel1 repeat-containing protein  35.56 
 
 
489 aa  41.6  0.004  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_1987  Sel1 domain-containing protein  39.13 
 
 
505 aa  41.6  0.004  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.461505  normal 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0225  Sel1 domain protein repeat-containing protein  30.34 
 
 
347 aa  41.6  0.004  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0851  hypothetical protein  31.58 
 
 
961 aa  40.8  0.005  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00404215 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4343  Sel1 repeat-containing protein  38.03 
 
 
182 aa  40.8  0.006  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1207  Sel1 domain-containing protein  28.71 
 
 
350 aa  40.8  0.007  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.838617  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_09250  tetratricopeptide TPR-like helical protein  34.58 
 
 
181 aa  40.4  0.008  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1450  Sel1 domain protein repeat-containing protein  31.68 
 
 
380 aa  40.4  0.009  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0854  hypothetical protein  32 
 
 
684 aa  40  0.009  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00109274 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>